新疆三个隔离人群Y染色体和线粒体遗传多样性分析

来源 :新疆大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wuchaoli87
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
新疆地处亚欧大陆腹地,自古以来是联系东西方文明的纽带。新疆地区人群的遗传多样性是长期以来东西方人群交流融合的结果,也是中华民族总体遗传构成中不可或缺的重要组成部分,是我国独特的遗传资源。而世居新疆的人群、尤其是至今仍然很少与外界交流、处于相对隔离生活状态的人群,是研究人群基因交流、环境适应以及地域性高发疾病的宝贵遗传资源。对新疆罗布人、克里雅人、刀郎人进行系统的遗传多样性研究,利用基因组数据研究人群的迁移和融合,开展以新疆隔离人群为模型的环境适应和疾病基因定位研究具有重要意义。Y染色体严格遵循父系遗传,而Y-NRY在减数分裂过程中不与X染色体配对,这使其只通过碱基突变来积累变异信息。通过测定Y-NRY的突变标记,可追踪父系遗传的进程。Y-SNP具有很强的地域特异性,测定不同地域人群的Y染色体单倍群类型,可推断人群进化、迁徙及相关历史活动,能有效地评估群体的遗传结构。通过对三个隔离人群Y染色体遗传多样性分析结果表明:克里雅人群检出12种单倍群,高频单倍群有J2a1b1(25.64%),R1a1a1b2a(20.51%),R2a(17.95%),R1a1a1b2a2(15.38%);罗布人群检出16种单倍群,高频单倍群有J2a1(43.75%),J2a2(14.06%),R2(9.38%),L1c(7.81%);刀郎人群检出40种单倍群,高频单倍群有R1b1a1a1(9.21%),R1a1a1b2a1a(7.89%),R1a1a1b2a2b(6.58%),C3c1(6.58%),三个隔离人群与维吾尔族亲缘关系较近;在单倍群类型和频率上与维吾尔族最接近且无显著性差异(f=0.833,p=0.367)。此外,三个隔离人群单倍群类型和频率显示明显的亚欧混合现象,经过长期基因融合使其具有中亚人群的典型特征,适用于法医遗传学。人类线粒体DNA是核外唯一遗传物质,呈闭合环状全长16569bp,由控制区和编码区构成,控制区碱基多态性使人群间存在高度特异性,这种碱基多态性可为人群的进化提供参考资料。mt DNA具有高突变率、母系遗传、无重组、单拷贝、不受选择压力影响等特征,使其成为人类学研究中重要的分子载体。通过对三个隔离人群mtDNA遗传多样性分析结果表明:克里雅人、罗布人、刀郎人mtDNA变异位点分别检出256,315,735处,其中多态性位点分别检出245,298,639处,A263G,A750G,A8860G,A15326G 4处位点在三人群中变异率均为100%;克里雅人检测出20种单倍型,高频单倍型有F1a1(15.71%),M8a2a1(12.86%),H1t(11.43%),M11a2(10.00%),罗布人检测出27种单倍型,高频单倍型有B5b2c(31.71%),H6a1b2(18.90%),D4c2a(13.41%),刀郎人检测出100种单倍型,主要集中在D,H,U,C主单倍型,各单倍型频率都不高,最高的为H2a1a(4.47%);三人群单倍型多样性分别为0.9264,0.8360,0.9910,平均核苷酸配对差异数目为30.2714,36.1220,32.5506,个体识别率为0.9132,0.8309,0.9854.三个人群单倍群类型和频率与维吾尔族最接近,亲缘关系最密切。此外,三个人群mtDNA遗传结构显示明显的亚欧混合现象,这与丝绸之路贸易的兴起-昌盛-衰落密不可分,是人群长期基因融合的结果。原发性高血压(essential hypertension,EH):是一种由某些先天性遗传基因与许多致病性增压因素和环境因素综合引起的多因素疾病,特点是不能发现导致血压升高的确切病因。本课题组在问卷调查和体质指标的测量时发现罗布人高血压患病率异常高,通过对罗布人基本临床指标和EH患者全线粒体基因组关联分析结果表明,罗布人EH患病率高达37.20%,年龄、BMI、腰围与EH有显著的关联性;线粒体全基因组分析在EH组共发现变异位点235处,未报道过的10处,对照组共发现变异位点253处,未报道过的13处;70个位点变异只在EH组中被发现,这些位点可能与原发性高血压的发生有直接关联,87个位点变异只在对照组中被发现,这些位点可能对原发性高血压的发生有抑制作用。获得的tRNA变异位点tRNA~Argrg T10410C,tRNA~Leueu A12308G,tRNA~Thrhr A15951G可能与EH相关;线粒体蛋白质基因变异位点ND1(G3316A,G3438A,T4248C),ND2(A4824G,C4919T,T4937C),COⅠ(T5964C,C6104T,G6734A,G6852A,A6881G),COⅡ(T7954C,G8020A),ATPase8(T8473C),ATPase6(A8633G,C8794T),COⅢ(G9477A,C9536T,A9632T,A9667G),ND3(C10181T),ND4(C11215T,A11467G),ND5(C12346T,G12372A,T13617C,C13720T,A13857G,T14287C,G14305A,T14319C,T14470C),Cytb(A14793G,C14815T,A14927G,T14979C,T15440C,C15448A,G15596A,A15758G)对EH的深入研究有意义。
其他文献
目的观察丹青胶囊急性毒性及对小鼠肝、肾功能影响。方法采用最大耐受剂量法计算急性毒性;各剂量组连续经口给药45d,第四十六天摘眼球采血作肝、肾功能检测,取肝肾器官作病理
汉魏六朝石刻记录了大量的复音词,以此作为主要研究对象,建立起汉魏六朝石刻复音词数据库,然后对汉魏六朝石刻复音词进行定量统计,并分别从语法构成和语义构成两方面对汉魏六朝石
说明从鱼眼镜头所拍摄图像恢复成原来图像的算法,在此基础上说明在固定视点上沿空间任何方向全景漫游的环境生成。
目的:进一步了解男性生殖道感染阴道加德纳菌(Gv)与配偶之间的互感率.方法:取男性精液携带Gv者的配偶阴道分泌物进行Gv套式PCR法检测.结果:随机抽取102例男性精液携带Gv者的
环境保护民事合同制度作为解决环境外部性问题的市场手段之一,在法律赋予企业组织和公民环境权的基础上,双方合意订立,最终达到分配效率和社会公益的统一。其发展启示来自科斯三
目的:探究非水溶性的四苯基卟啉氯化锰[(TPP)MnCl]与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用方式及机理。方法:借助紫外-可见光谱、荧光光谱和电化学等手段研究了(TPP)MnCl与ctDNA相互
作者对1949年至1982年底前后34年的妄想型精神分裂症1604例进行分析,发现妄想主题随文化背景而变化,且随性别而有异。至于情感与行为障碍的出现频率也有变化。
中国改革开放40年来取得了巨大成就,习近平主席提出的“一带一路”倡议取得了丰硕成果,作为中日合作的新平台,“一带一路”倡议在促进中日互利共赢、共同发展的同时,也将为第
目的:观察散结枯痔、消肿止痛类中药配合外剥内扎术治疗混合痔的疗效。方法:采用消痔灵注射液(五倍子、明矾等)注射配合外剥内扎手术治疗本病125例。结果:总有效率100%。结论
<正>纳米医学技术是一门新兴的科学技术,为许多疾病的诊治提供了全新的思路。因纳米材料具有独特的物理、化学性质和较好的生物相容性被广泛应用于妇产科疾病的早期诊断、靶