骨肉瘤患者组织标本间的差异蛋白质组学研究

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:seankkk2000
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:骨肉瘤是原发于骨髓的高度恶性肿瘤,是一种间叶组织来源的恶性肿瘤,其特征是增殖的肿瘤细胞直接形成骨或骨样组织。骨肉瘤好发于10~20岁的青少年,目前局部发病未发生转移的骨肉瘤患者接受手术治疗及新辅助化疗后5年生存率可达到60%-70%。然而其病程短且进展快,早期即可出现转移,最常经血行转移至肺。因大多数骨肉瘤患者症状隐匿,有些患者初诊较晚,就诊时已经出现肺转移,这类患者即使接受新辅助化疗,其对化疗药物会产生很强的耐药性,其5年生存率只有20-40%左右,预后较差。比较蛋白质组学探索不同时期、不同组织、不同状态或不同外界条件作用下细胞或生物体的蛋白质表达变化的相关信息,可以明确重要生理及病理体系差异蛋白质的表达,发现其异常的原因。其技术的发展使得高通量筛选不同类型的肿瘤或正常组织的差异蛋白质成为可能,差异表达蛋白质的分析鉴定为肿瘤分子标记物及新药物治疗分子靶点的发现奠定了基础,为我们更有利于了解生命活动规律提供了帮助。本课题比较早期发生肺转移的骨肉瘤与早期没有发生肺转移的骨肉瘤间的差异表达蛋白质,在蛋白质水平探查骨肉瘤发生发展、耐药及转移机制,为骨肉瘤的早期诊断、预后判断和个性化治疗等提供依据。方法:收集2014年1月至2016年1月河北医科大学第三医院骨与软组织肿瘤科确诊并通过手术切除的骨肉瘤标本6例,其中分为发病1年内发生肺转移的3例(Ⅰ组)和发病1年内没有发生肺转移的3例(Ⅱ组),利用TCA-丙酮沉淀法分别对收集的Ⅰ组和Ⅱ组样品提取总蛋白,各组混合后再由胰酶对各组总蛋白质进行消化为多肽。以不同i TRAQ试剂盒对各组总蛋白消化得到的肽段分别进行标记,将混合肽段用强阳离子交换柱和C18反向柱进行分级分离,采用液质联用质谱检测技术进行鉴定,数据结果经Mascot检索软件在Uniprot_human数据库中进行检索,得到两组样本的总蛋白谱和差异蛋白相对定量定性结果。我们对所得数据以阈值(差异倍数大于1.5,p值小于0.05)进行筛选,对鉴定得的蛋白质进行pathway生物信息分析,得到相应的生物信息通路信息。结果:根据筛选条件,我们通过Proteome Discoverer 1.3软件共找到两组间差异表达蛋白202个,KEGG信号通路数据库分析发现了这些差异表达的蛋白质涉及许多癌症相关的生物信息通路,如:病毒致癌、恶性肿瘤中蛋白聚糖、恶性肿瘤中小分子核糖核酸、癌症生物路径等,此外这些差异表达蛋白质还涉及与细胞及蛋白迁移的相关生物信息通路,如:白细胞游出迁移、肌动蛋白细胞骨架的调节、粘着斑、紧密连接等。其中在这些信号通路中重复率较高的6个相关差异表达蛋白是:α辅肌动蛋白-1、α辅肌动蛋白-4、肌球蛋白调节轻链-9、肌糖蛋白、纤连蛋白和层粘连蛋白α4。其中早期发生肺转移骨肉瘤患者标本中表达上调的蛋白有肌糖蛋白、纤连蛋白和层粘连蛋白α4;早期没有发生肺转移的骨肉瘤患者标本中表达上调的蛋白有α辅肌动蛋白-1、α辅肌动蛋白-4和肌球蛋白调节轻链-9。结论:1以早期有无发生肺转移的骨肉瘤患者标本作为研究对象,首次采用i TARQ结合LC-MS/MS的方法筛选出了骨肉瘤转移相关的差异表达蛋白共202个,KEGG信号通路数据库分析显示了差异蛋白质涉及的信号通路,为研究骨肉瘤的浸润转移机制提供了线索。2发现α辅肌动蛋白1(ACTN1)、α辅肌动蛋白4(ACTN4)、肌球蛋白调节轻链9(MYL9)在早期没有发生肺转移的骨肉瘤患者标本中高表达;而肌糖蛋白(TNC)、纤连蛋白(FN)、层粘连蛋白α4链(LAMA4)在早期发生肺转移的骨肉瘤患者标本中高表达;说明这几种蛋白可能与骨肉瘤的侵袭转移关系密切。3本研究对早期有无肺转移的骨肉瘤患者标本组织进行了差异蛋白质组学的初步研究,为探讨与研究骨肉瘤发生发展、恶化及转移等奠定了基础;为对骨肉瘤早期诊断、预后判断以及发现新治疗分子靶点从而有效治疗等提供了依据。
其他文献
镁合金具有轻质高强,资源丰富等优势,并已应用于航空航天、汽车工业等领域。然而,耐腐蚀性能差的不足严重制约着镁及镁合金的进一步推广应用。采用表面覆铝的方法,将两层6061
2012年是实施"十二五"规划承上启下的重要一年,我们将迎来党的十八大和省十次党代会。做好我省今年经济工作,保持经济平稳较快发展,具有特殊重要的意义。按照中央经济工作会议
<正>10月18日,由工信部牵头编写的《中国区块链技术和应用发展白皮书》(以下简称"《白皮书》")发布,《白皮书》指出,金融服务将是区块链第一个应用领域,因其所拥有的高可靠性
基于江苏省“十二五”环境质量监测网络优化调整工作,指出监测点位设置和管理工作中存在的问题,讨论了点位优化调整的原则和思路,总结监测网络调整结果,并开展点位优化调整的成效
在对城市规模效益相关理论进行分析的基础上,从经济效益、社会效益、生态效益3个方面构建了城市规模效益综合评价指标体系;然后运用灰色关联综合分析法,对重庆不同等级城市的
利用系统溶剂法及L9(34)正交实验探讨从金银花及金银花叶中提取黄酮类,其最佳提取工艺为90%乙醇、物料比1:12,于70℃温浸60min。
国家安全是国家生存与发展的首要前提,国家安全法治建设是国家安全的基本制度保障。我国已将打击恐怖主义纳入国家安全战略,反恐情报信息贯穿于反恐怖主义各项工作的始终,要
实验发现,流屑角突变现象是具有较大应用潜力的切削现象,但是,人们对其机理缺乏足够的了解。建立描述流屑角突变现象的数学模型,是从本质上探究流屑角突变的发生机制和规律的
孟昶,是五代十国时期后蜀的最后一个皇帝。其父孟知祥,于934年建立后蜀,在位仅七个月就死了。孟昶于同年7月践祚,至965年国亡入宋,在位三十一年,事实上他的统治与后蜀政权相
本文回顾性分析了我院60例慢阻肺病人的护理措施(包括一般护理、对症护理、心理护理、康复后护理等),探讨出一套综合的护理方法,以期改善和提高患者的生活质量。