中国汉族人群散发性帕金森病易感基因的全基因组关联分析

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目的:对散发性帕金森病(Sporadic Parkinson’s disease, SPD)患者做全基因组关联分析研究(genome-wide association study,GWAS),获得易感基因位点,探讨风险基因的多态性是否与SPD相关,国内外SPD易感基因是否存在差异性,初步阐明风险基因的多态性在SPD发病机制中的作用。方法:对照组(健康成人组,n=200),病例组(SPD确诊患者组,n=200),收集分析患者临床资料,抽取外周静脉血,分别提取DNA,行DNA浓度与光密度测定,基因芯片扫描,数据结果分析,pathway分析,找出与SPD相关差异有显著统计学意义的基因位点。结果:①经临床资料分析,病例组平均发病年龄(59.3±10.8)岁,40岁以前和80岁以后发病少见,男女发病比例1.1∶1;对照组平均年龄(59.8±11.6)岁,男女比例1.6:1;②通过质量控制的有基因诠释信息的SNPs位点864108个,无基因诠释信息的SNPs位点7873个;③验证国内外已报道过的SPD易感基因:PARK2(rs9355958,rs12526148,rs9365352)、LRRK2(rs10506151)、SNCA(kgp9010977)基因;④pathway分析发现3个通路可能与SPD相关,共199个基因;⑤发现新的可疑SPD风险基因位点:细胞凋亡通路中IRF2(rs10520563)、 MAP2K4(rs16946068)、 FASLG (rs2077690)、 RIPK1(kgp7992710)、CRADD(kgp5340584)、PIK3R1(rs6866288)基因,线粒体基因表达通路中PPARGC1A(rs618283)基因,线粒体脂肪酸β-氧化作用通路ACSL1(kgp7557877)基因。结论:经DNA混合池基因芯片杂交试验及数据分析、pathway分析的GWAS研究,验证了国外已发现的SPD易感基因,并且发现新的可疑的SPD易感基因。说明一些易感基因可存在于不同种群,并且对疾病发生具有重要作用;我们中国汉族人群中还可能存在异于欧美人群的SPD易感基因。这对今后进一步研究SPD发病机制可能起到重要作用。
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