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目的:探讨HIV-1 gpl20 V4区氨基酸变异对CCR5及CXCR4嗜性毒株侵入相应靶细胞及亲嗜性转换能力的影响,明确V4区在病毒侵入靶细胞中的作用。
方法:本研究从Los Alamos HIV序列数据库中,下载己知亲嗜性的HIV-1 B亚型包膜糖蛋白V4区氨基酸序列252株。利用生物信息学方法对V4区氨基酸序列的长度、潜在糖基化位点、相对于consensus-B的遗传距离及净电荷数进行分析。采用spearman秩相关及Wilcoxon秩和检验统计方法,探讨V4区变异与病毒亲嗜性的关系.然后通过构建CCR5(ADA)及CXCR4(HXB2)嗜性毒株V4区氨基酸缺失及氨基酸替换突变体伪病毒,进行感染实验及融合实验,对V4区氨基酸变异对CCR5及CXCR4嗜性毒株侵入相应靶细胞及亲嗜性转换能力的影响进行探讨。
结果:1)HIV-1 B亚型已知亲嗜性的V4区氨基酸序列分析表明,V4区氨基酸序列无论在序列长度、潜在糖基化位点数目、净电荷数目及相对于consensus-B的遗传距离都显现出高度多样性。2)统计分析显示,CCR5比CXCR4(R5X4)嗜性毒株,具有更长的V4区序列(P=0.036)及更多的潜在糖基化位点(P=0.008)。无论是CCR5嗜性病毒还是CXCR4(R5X4)嗜性病毒,V4区氨基酸序列长度与潜在糖基化位点数目具有较强的正相关性(r=0.465,P<0.001;r=0.435,P<0.001)。相对于consensus-B的遗传距离,CXCR4(R5X4)嗜性病毒比CCR5嗜性病毒V4区具有更高的变异性(P<0.001)。3)V4区氨基酸出现频率分析发现,CCR5和CXCR4(R5X4)嗜性毒株V4区N末端386~395位(HXB2株氨基酸序列号)及C末端414~417位氨基酸都具有较高的保守性。其中L390、F391、W395及L416高度保守,保守性在95%以上。N386、N392及N406潜在糖基化位点都具有较高的保守性,保守性在88%以上。4)通过构建突变体伪病毒,进行感染实验及融合实验结果显示,ADA株及HXB2株N末端(NSTQLFNSTWNFN)和C末端(NGTEGNDTITLP)缺失突变体,使病毒丧失侵入CCR5及CXCR4细胞的能力。而中间区域缺失突变体仍保留部分侵入靶细胞能力。ADA株V4区相同区域缺失突变体侵入能力降低程度大于HXB2株。5)ADA株及HXB2株,N末端丙氨酸替换突变体ADAs389-391、HXB2s386-388及HXB2s389-391;C末端突变体ADAs411-413、ADAs414-417及HXB2s414-417均丧失侵入CCR5及CXCR4细胞的能力。其他区域丙氨酸替换突变体仍保留部分或全部侵入靶细胞能力。6)ADA及HXB2株391F/A突变均丧失侵入能力。7)疏水突变成极性氨基酸,ADA株ADA390L/G和ADA416L/G丧失侵入能力,ADA414I/G仅保留侵入能力的1%:HXB2株突变体HXB390L/G,HXB414I/G及HXB416L/G仅侵入能力的4%±1%,16%±5%和14%±5%。8)改变386N、387S、388T、389Q、408T、411N及413T的亲水性,病毒侵入能力没有改变。9)ADA株417P/A突变使病毒产生侵入CXCR4细胞的能力。
结论:1)HIV-I B亚型R5嗜性毒株V4区比X4(R5X4)嗜性毒株具有更长的氨基酸序列、更多的潜在糖基化位点及负电荷。2)V4区N(386~391)及C末端(414~417)氨基酸保守性在70%以上,截短突变导致病毒丧失侵入能力。3)V4区390L、414I及416L分别在98%、88%及95%以上的序列中保守,疏水突变成亲水氨基酸(390L/G、414I/G及416L/G)使侵入能力降低80%或完全丧失;391F在99.5%的毒株中保守,391F/A突变使病毒丧失侵入能力,对维持病毒侵入能力起重要作用。4)V4区386-388潜在N-糖基化位点在88%以上序列中高度保守,但该糖侧链本身不是影响病毒侵入能力的关键,386N氨基酸残基的性质影响病毒侵入能力。