20世纪90年代，美国经济的持续走强在很大程度上都依赖于其技术创新的能力。今天，人们更是把技术创新能力作为一国的核心竞争力之一，一个国家技术创新能力的高低己经成为衡量一个国家发展潜力的重要指标。而对于高新技术企业来说，技术创新是企业增加利润，扩大市场份额的根本途径之一。因此高新技术企业势必要在技术创新过程中发挥主体作用。作为高新技术孵化器的高新技术企业，其R&D支出作为技术创新的根本性源泉更应引起高新技术企业的高度重视，然而大量的研究认为很多高新技术企业R&D支出活动没有考虑到管理层的私人成本问题，还有企业固有的委托代理问题，致使管理层对R&D支出的积极性不高，或者是R&D支出的效果不明显。为了弥补这一不足，势必需要有让管理层进行R&D支出的动力机制。因此，如何制定符合我国当前国情的股权激励政策，来促进高新技术企业R&D活动管理层及核心技术人员提高R&D支出，弄清股权激励政策对高新技术企业R&D支出的影响机制是当前有待解决的新课题。　　 本文先从国内外的高新技术企业的R&D支出状况及存在的问题进行了探讨，而后通过股权激励博弈过程建立涉及股权比例的数学模型，对其进行求解，并对参数的意义进行了讨论。实证部分是收集了2006年的国内上市公司的112家上市公司的数据，进行了回归检验，得出了与模型解析相同的结论。　　 本文在国内外相关研究的基础上，以委托代理理论、激励理论和人力资本理论为理论基础，采用定性分析和定量分析相结合的研究方法，对股权激励在我国高新技术企业中的应用状况、与高新技术企业R&D支出水平的关系进行探讨与研究，寻求能够适合高新技术企业特征、满足其R&D人才需求的有效的股权激励应用方式。