基于蛋白组学技术筛选慢性高原病患者血浆差异蛋白的研究

来源 :青海大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:andyower_2009
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目的:通过实验发现高原缺氧状态下蛋白质组学的差异,为慢性高原病的诊断和发病机制研究提供参考依据。方法:选取2020年1月—2021年1月居住在海拔2500m以上地区,符合青海标准诊断为慢性高原病的患者10例为实验组,对同期同海拔的体检者作临床体检,筛选健康对照组10例为对照组,所有研究对象均来源于青海省人民医院门诊部,标本采集为72小时以内来院且未到访其他地方。运用高效液相色谱质谱联用方法进行血浆差异蛋白鉴定和定量,针对筛选出来的血浆差异蛋白进行GO、KEGG功能、结构域显著富集和互作网络分析等一系列的生物信息学功能分析。结果:1.与正常对照组相比,高原实验组血浆蛋白质组学分析显示总差异数117个,32个显著差异表达点,其中11个点表达下调,21个点表达上调。2.血浆差异蛋白质生物信息学分析:GO富集分析生物学过程中包括免疫反应、补体激活、激活蛋白级联、凝血系统;KEGG显著性富集主要参与的途径是轴突导向、溶酶体、细胞粘附分子、脂质和动脉粥样硬化、造血细胞谱系、胆固醇代谢;显著富集的结构域主要在免疫球蛋白样结构域、类EGF域、纤维连接蛋白III型超家族、丝氨酸蛋白酶、Sushi/SCR/CCP超家族。3.慢性高原病组和健康对照组差异表达蛋白火山图、热图表明,与对照组相比,显示出慢性高原病血浆蛋白质水平有一定的变化。结论:1.在本研究中,通过高通量血浆蛋白质组学的分析技术,有助于揭示慢性高原病的功能机制,也有助于识别在病理状态下发生或进展相关的靶蛋白。2.通过血浆蛋白组学发现慢性高原病与健康对照组具有一定的差异性,显著下调蛋白质主要为IGFALS、F9、MDH1、RPS27A、MYL6、FCN3;显著上调蛋白质主要为IGLC2、CRP、LRP-1、DAG1、HBB、PGLS。3.通过生物信息学分析发现了慢性高原病差异蛋白主要生物富集功能存在于氧化应激、炎症反应、补体级联、凝血途径和免疫反应中。4.差异蛋白互作分析节点数最多的差异蛋白为MPO、RPS27A、ARG1、GM2A、TIMP1、CRP、FABP5、HBB、S100A7、RHOA。
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