异毛纲纤毛虫分布广泛,普遍体型巨大且体色亮丽,在微型食物网的物质循环与能量流动中作用巨大,且被作为模型生物在细胞生物学、遗传学等领域广泛应用。瓶囊虫科是异毛纲10个科中物种最丰富的科（33属79种）,具有透明的瓶囊与复杂的生活史（自由游动的游泳体和固着生活的成体）而与其他类群明显区分。因其常附于其他水生生物体表而难以采集、瓶囊隔离而不易着色等原因,该类生物研究的背景资料严重不足。已知的79种瓶囊虫中,仅有7种具有现代分类学信息。作者于2018–2020年间,以海洋湿地、咸水湖泊、海湾开放水体等各类海洋生境为采样客体,运用纤毛虫现代分类学研究方法,开展目标生物的分类学与分子系统学研究。主要研究结果如下:1)整理汇集瓶囊虫科的历史文献,结合本研究中通过现代研究手段获得的重要分类学特征,筛定6个该科生物的通用特征,对瓶囊虫科37个已知下辖属进行修订厘清,清理核定了4个同物异名属,为剩余33个属提供修订定义并制定检索表。2)分离和鉴定瓶囊虫科纤毛虫5种,隶属于4属,包括1个新属:全瓶囊虫新属（Diafolliculina n.gen.）。2个新种:长耳全瓶囊虫新属新种（Diafolliculina longilobata n.gen.,n.sp.）和宋氏后瓶囊虫新种（Metafolliculina songi n.sp.）;1个中国新纪录种:莫氏真瓶囊虫[Eufolliculina moebiusi（Kahl,1932）Had（?）i,1951];2个亚热带种群:细颈壶腹瓶囊虫（Ampullofolliculina lageniformis Had（?）i,1951）和延长后瓶囊虫[Metafolliculina producta（Wright,1859）Dons,1934]。3)分别对细颈壶腹瓶囊虫（Ampullofolliculina lageniformis Had（?）i,1951）、延长后瓶囊虫[Metafolliculina producta（Wright,1859）Dons,1934]、宋氏后瓶囊虫新种（Metafolliculina songi n.sp.）的生活史做了全面的追踪,详细描述了瓶囊虫科两个不同类型的生活史。4)所涉5种（包括2种游泳体）都进行了全DNA提取及SSU r DNA基因测序,并构建分子系统树。同时结合形态特征,初步探讨了瓶囊虫科内的系统进化关系。