三种跳虫肠道菌群的多样性分析及其功能研究

来源 :东北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:A123_1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
跳虫是一类原生无翅的内口式低等微小型六足总纲节肢动物,种类繁多且分布广泛。它们主要取食土壤中的枯枝落叶、腐殖质、细菌和真菌等,而对这些有机物的分解与利用需要肠道内复杂微生物的协助来完成。为了探究跳虫肠道菌群的多样性及其相关功能,本研究以裸(拟裸)长角跳属成员Sinella(Coecobrya)oligoseta、原等跳属成员Proisotoma minuta和鳞跳属成员Tomocerus missus为供试跳虫,采用16S r DNA扩增子测序法对这3种跳虫成虫的肠道菌群进行分析和比较,并应用Tax4Fun法对其肠道菌群基因进行功能预测。同时,使用传统分离培养法获得可培养跳虫肠道菌,从中筛选能降解可溶性淀粉、羧甲基纤维素钠和果胶的细菌,初步评估其产酶能力,并进行菌种分子鉴定;从中筛选动物肠道常见致病菌气单胞菌,进行多位点序列分型分析、毒力基因及药敏性检测。研究结果发现这3种跳虫成虫中肠道菌群多样性最高的是T.missus,最低的是S.(C.)oligoseta。在门水平上,它们肠道中最主要的菌群均为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),放线菌门(Actinobacteria)也具有较高的丰度;在属水平上,S.(C.)oligoseta肠道中假单胞菌属Pseudomonas的相对丰度(16.21%)明显高于P.minuta和T.missus肠道中的相对丰度(分别为0.87%和1.37%);P.minuta肠道中弧菌属Vibrio的相对丰度(25.81%)明显高于S.(C.)oligoseta和T.missus肠道中的相对丰度(分别为3.35%和0.004%)。KEGG pathway注释预测出这3种跳虫肠道菌群中相对丰度最高的功能基因涉及碳水化合物与氨基酸代谢,且与人类疾病相关的功能基因中涉及传染性疾病和耐药性的基因相对丰度明显较高。从这3种跳虫肠道内分离得到的106株细菌中有47株可以降解多糖的细菌,其中包括37株产淀粉酶细菌,主要是微杆菌属Microbacterium和芽孢杆菌属Bacillus的一些种类;16株产纤维素酶细菌,主要是纤维菌属Cellulosimicrobium和芽孢杆菌属Bacillus的一些种类;以及3株芽孢杆菌属Bacillus和类芽孢杆菌属Paenibacillus的产果胶酶细菌。菌株Tm-L4同时具有产淀粉酶、纤维素酶和果胶酶活性,经16S r DNA序列比对,发现该菌株与解淀粉类芽孢杆菌Paenibacillus amylolyticus有99.79%的序列相似性。另外,从S.(C.)oligoseta和P.minuta肠道菌中分离得到3株豚鼠气单胞菌Aeromonas caviae,对豚鼠气单胞菌管家基因进行多位点序列分型,结果显示属于新的序列型ST653,对应的等位基因型为gyr B456、gro L438、glt A465、met G462、pps A503和rec A499。对豚鼠气单胞菌基因组中毒力基因PCR扩增后发现,脂肪酶基因lip、弹性蛋白酶基因ela、热敏感细胞肠毒素基因alt、溶血素基因hly A和鞭毛基因fla为阳性。抗生素药敏试验显示豚鼠气单胞菌对氨苄西林、氨苄西林-舒巴坦、四环素和萘啶酮酸均表现为耐药,而对阿奇霉素、氯霉素、阿米卡星等12种抗生素表现为敏感。从上述结果可知,S.(C.)oligoseta,P.minuta和T.missus这3种跳虫成虫肠道菌群在门水平上的核心菌群相同,而在属水平上的优势菌属存在较大的差异,其中跳虫的物种遗传背景及栖息地环境中微生物种类和数量可能是影响其肠道菌群多样性的重要因素;3种跳虫肠道内大多数细菌与能量代谢及营养作用相关,这有利于它们发挥土壤生态系统中分解者的作用,而且所筛选的产酶能力较高可降解淀粉、纤维素和果胶的菌株有望被进一步研制成益生菌、饲料添加剂或酶工程菌,在食品、养殖及酶产业中发挥价值;3种跳虫肠道中可能还存在具有致病性或抗生素耐药性的微生物,已分离得到的新型豚鼠气单胞菌的毒力基因与药敏性试验结果揭示了该菌的潜在致病性及其对抗生素的耐药或敏感性,为跳虫源豚鼠气单胞菌可能引发相关疾病的预防及抗生素使用提供了理论依据。
其他文献
报告人于2019年7月至2019年10月在博世汽车部件有限公司实习并在此期间承担了部门的口译工作。此报告主要基于报告人口译工作中的汉英会议口译部分。报告人在翻译过程中遇到
目的:研究山苍子油对体外培养的人乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖的影响以及在乳腺癌荷瘤裸鼠模型中,对肿瘤生长和转移的影响,并就其可能的作用机制进行初步探讨。方法:CCK-8比色法和流式细胞术(FCM)分别检测山苍子油对MDA-MB-231细胞增殖的影响和对细胞凋亡及其周期的影响;Western blot方法检测经山苍子油作用后MDA-MB-231细胞凋亡相关蛋白Bax,Bcl-2、caspase
自1980年代以来,全球邮轮产业以年均8.2%的复合增长率快速发展。然而在邮轮中下游产业蓬勃发展的同时,却存在着上游邮轮建造产业供不应求、垄断严重的现象。同时,2018年我国首次出现邮轮游客数负增长的情况,标志着我国邮轮产业进入了深度调整期,急需进行产业结构调整。全球豪华邮轮建造市场的巨大需求给我国邮轮产业提供了全新的发展机遇,建造国产豪华邮轮不仅能延长我国邮轮产业链长度,提升综合竞争力,更能与国
在当下基于位置服务(LBS)领域中,使用WIFI等电磁信号的室内定位服务是目前市场所开发与研究的热点。但室内环境的复杂结构会对无线信号产生屏蔽干扰等问题,导致电磁信号的多径效应,从而严重影响室内定位的精度。针对现有WIFI室内定位存在的问题,本文基于OFDM(Orthogonal Frequency Division Multiplexing)技术,选择从WIFI物理层采集的CSI信号替代RSSI
在21世纪,越来越多的工业、军事、医疗和消费产品是实时嵌入式软件密集型系统,系统的开发变成一项复杂而又关键的任务。事实上,嵌入式系统必须实现一组由其环境决定的非功能
土壤湿度的检测在农业生产中有着重要的作用,及时监测土壤湿度,就能够及时分析土壤干旱状况,及时了解农作物的生长发育状况,保障农业生产。传统的近红外土壤湿度检测方案,其
央视公益广告文案的研究,选取了 2013-2017年以来,共计183篇央视公益广告的文案作为研究样本,开展对央视公益广告文案的语言特征、创作策略以及文案效果的分析与调查研究。发
随着全球人口的不断增长,人们生活质量不断地提高以及城镇化、退耕还林还草、环境污染导致耕地面积的减少,给我国粮食生产带来了巨大的压力。不断地提高粮食的产量与品质对于
牛奶由于富含大量我们所需的营养而成为我们必不可少的食物来源,牛奶中的乳脂更是因为它能提供我们所需的营养并且能够在体内转化为大量的能量,而被人们日益关注。如今对于是否能够生产高品质的牛奶以满足人们的需求已经成为优质食品发展的重要课题,但是我国当前奶牛的产奶量还不够高,牛奶质量也有待提升。因此提高乳质量,生产具有足够乳脂的优质牛奶是我们当前急需解决的问题。长链酰基辅酶A合成酶6(long-chain
随着养生文化的传播和健康观念的转变,中医正逐步得到国际社会的认可和接受。每年有很多外国留学生来华学习中医。在中医对外教学中,口译是必不可少的。报告人参加了南京中医