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微生物多样性研究对微生物资源的开发利用与环境保护具有重要意义。本研究通过PCR-DGGE(PCR-Denaturing Gradinent Gel Electrophoresis)技术对内蒙古西部地区土壤细菌、真菌、放线菌的多样性与群落结构进行了研究。研究结果显示,针对内蒙古西部地区土壤沙粒含量高的特点,将物理、化学与酶法相结合的DNA提取方法可以获得高质量的土壤总DNA。内蒙古西部地区土壤微生物资源非常丰富,优势菌菌种种类相对较多,其中细菌的丰富度是最高的,细菌优势菌群主要包括Proteobacteria(变形菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门)、Firmicutes(厚壁菌门)、Actinobacteria(放线菌门)、Acidobacteria(酸杆菌门)、Gemmatimonadetes(芽单胞菌门)、Nitrospira(硝化螺旋菌门)。放线菌优势菌群包括Saccharopolyspora(糖多孢菌属)Thermomonospora(高温单孢菌属)、Streptomyces(链霉菌属)、Iamiaceae(酸微菌属)、Corynebacterium(棒杆菌属)、Timonella、Pseudonocardia(假诺卡氏菌属)7个属。真菌优势菌群包括Ascomycota(子囊菌门)与Basidiomycota(担子菌门)两个门。微生物多样性分析表明,细菌多样性最为丰富,放线菌次之、真菌最低。BT11的栗钙土的细菌丰富度与香浓指数最高;WH2的灰漠土细菌丰富度与香浓指数最低;细菌均匀度指数BTl的栗钙土最高,WH12的风沙土最低。BT4的栗钙土的真菌丰富度与香浓指数最高:BM26的风沙土真菌丰富度与香浓指数最低;真菌均匀度指数BT1O的栗钙土最高,BT1栗钙土最低。BTI1的栗钙土的放线菌丰富度与香浓指数最高;WH2的灰漠土和WH11的风沙土放线菌丰富度与香浓指数最低;放线菌均匀度指数BT12的灰褐土最高,BT34盐土最低。另外,相同土壤类型微生物分布会受到经纬度、土壤利用方式等因素的影响。