应用生物信息学分析及组织芯片技术研究TRIM59蛋白在非小细胞肺癌中的表达及意义

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目的:肺癌是肿瘤相关死亡的首要死因,其预后较差,近些年来发病人数逐年增加,对社会人群生命的危害较大。身为TRIM家族蛋白的组成之一,TRIM59蛋白在各种细胞过程中发挥E3泛素连接酶的作用,参与细胞内信号传导、发育、凋亡、蛋白质质量控制、先天免疫、自噬和致癌等生物行为。在本研究中,我们使用生物信息学分析和组织微阵列评估TRIM59蛋白在非小细胞肺癌治疗中的预后意义。方法:采用免疫组织化学方法在组织芯片中检查TRIM59在NSCLC患者中的表达情况。应用Oncomine和癌症基因组图谱(TCGA)的数据集进一步验证TRIM59在NSCLC及其亚型肺腺癌(LUAD)和肺鳞状细胞癌(LUSC)中的表达水平。最后明确TRIM59在NSCLC患者中的预后价值。结果:利用Oncomine数据集,初步发现TRIM59基因在多种常见肿瘤中存在差异表达,并且其在肺癌及其亚型中的表达水平较正常肺组织显著偏高。然后根据免疫组化实验结果,得出TRIM59蛋白在NSCLC中的染色情况显著偏高的结论。TCGA数据集进一步验证上述结论,在正常癌旁肺组织与NSCLC中,TRIM59 m RNA的表达情况存在显著的差异(P<0.0001)。此外,TRIM59表达水平与肿瘤分化程度有关(P=0.012),而TRIM59染色情况与肿瘤T分期(P=0.781)、淋巴结N分期(P=0.684)、TNM分期(P=0.457)及其他临床病理参数之间未观察到关联。生存分析发现,TRIM59高表达组的NSCLC患者的总体生存时间显著低于TRIM59低表达组的患者(P=0.014),尤其是在肿瘤分化程度较差的患者中(P=0.033)。单多因素Cox回归分析表明,TRIM59蛋白表达水平(P=0.018)、年龄(P=0.047)、淋巴结转移情况(P=0.038)可作为独立风险变量对NSCLC患者的生存预后产生不良的影响。结论:综合生物信息学和免疫组化分析,我们推测TRIM59蛋白可以成为NSCLC患者早期诊断和预后的新型分子生物标志物。
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