CCCH类型锌指蛋白是植物锌指蛋白中的一大类,它包含一个或多个由三个半胱氨酸残基和一个组氨酸残基组成的基序。玉米中CCCH蛋白研究非常少。到目前为止没有仟何研究从基因组水平对此基因家族进行分析。本研究运用生物信息学的方法对玉米全基因组CCCH锌指蛋白基因家族进行分析,系统研究这些基因的结构特征和进化关系,并与拟南芥进行比较,获得如下主要结果：1.采用BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)和HMM (Hidden Markov Model)分析方法,对玉米全基因组进行搜索比对,共鉴定出68个标准CCCH基因,68个CCCH(ZmC3H1-68)基因可以分为7个亚家族。2.玉米CCCH基因染色体位置分析结果表明,这些基因在染色体上的分布是不均等的,其中以3号和8号染色体上分布最多,7号和9号染色体上分布较少。通过对玉米CCCH基因复制的研究,发现基因复制主要发生在3号和8号染色体上.研究表明基因的片段复制对CCCH(?)辛指蛋白数量扩张起到显著作用。通过计算Ka/Ks的比值,玉米中发生基因复制的CCCH基因主要经历了纯化选择并且估计了与CCCH基因相关片段复制事件发生的时间。4.对玉米CCCH基因的结构进行分析,位于进化树同一亚家族的成员其基因结构非常相似,所含外显子和内含子的数目也基本相同。分析结果显示玉米CCCH蛋白的结构比较复杂,CCCH基序中3个半胱氨酸残基和1个组氨酸残基是高度保守的。5.在预测的12个可能参与逆境胁迫反应的玉米CCCH基因中选择了7个基因,利用荧光定量PCR检测这些基因在玉米不同组织中的表达模式,并且检测在ABA和干旱处理条件下的表达模式。检测结果表明7个可能参与逆境胁迫反应的基因在玉米各个组织中都有表达但这些基因在各个组织中的表达强度不同在ABA和干旱处理后,玉米7个CCCH基因的表达量都增加了。