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【目的】检测EB病毒性脑炎（Epstein-Barr virus encephalitis，EBE）患儿外周血淋巴细胞亚群百分比的变化，分析EBE患儿脑脊液中EB病毒DNA载量与其相关性；比较EBE、化脓性脑膜炎及支原体脑炎三种脑炎患儿外周血淋巴细胞亚群百分比。【方法】选取2012年1月至2013年2月在山西省儿童医院神经内科住院并确诊为EBE的患儿共15例作为观察组，21例化脓性脑膜炎、17例支原体脑炎患儿及35例健康儿童作为对照组，所有研究对象均在入院后第2天清晨采集空腹外周静脉血2ml，采用流式细胞术检测外周血淋巴细胞亚群百分比，采用SPSS13.0统计软件进行统计分析，以P<0.05为有统计学意义，并分析它们与脑脊液EB病毒DNA载量的相关性。【结果】1、 EBE患儿外周血中总T淋巴细胞、 Th细胞(CD4+）、 NK细胞（CD3-CD(16+56)+）亚群百分比明显低于健康儿童，Ts细胞（CD8+)和B细胞（CD19）亚群百分比明显高于健康儿童，差异均有统计学意义（P<0.05）；2、EBE患儿脑脊液EB病毒DNA载量与Ts细胞（CD8+)细胞亚群百分比呈正相关（P<0.05）；3、总T淋巴细胞和B细胞（CD19）亚群百分比在三组脑炎间的比较中差异均有统计学意义（P<0.05）。【结论】EBE患儿存在淋巴细胞免疫功能紊乱，且其程度与脑脊液EB病毒感染量有关，在抗病毒治疗的同时实施免疫调节治疗有一定临床价值，同时本研究结果为区别不同类型中枢神经系统感染的诊断及治疗提供一定理论依据。