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单片段导入系（Single Segment Introgression Lines，SSILs）是利用多代回交和分子标记辅助选择构建的永久定位群体，是进行QTL 遗传分析的理想材料。与传统的定位群体相比，单片段导入系具有遗传背景清楚、群体遗传稳定、QTL 定位和鉴定的精确度和灵敏度高、QTL 遗传效应分析准确、可用于重复试验开展QTL 与环境的互作及QTL 间的互作研究等优点。
本研究通过玉米综3(Zong3）遗传背景的98个单片段导入系（Z3HBILs）及各导入系与Zong3的测交组合为材料，并利用120个SSR 标记结合表型对该群体进行评价，鉴定株高、穗位高QTL及其互作网络研究。主要结果如下：
1.两年株高QTL 共检测到9个，贡献率为3.09％～22.55％之间,3个为加性效应；
穗位高QTL 有14个，贡献率为4.98％～19.77％之间，加性效应位点有3个，所检测到的QTL大多表现为非加性作用方式。
2.两年共检测到株高主效QTL 间具有互作效应的有18 对，贡献率为4.231％～31.988％之间；穗位高主效QTL 间具有互作效应的有13 对，贡献率为4.813％～31.028％之间，在两年所有株高和穗位高主效QTL 间的互作效应中，加×加互作仅有4 对，以上结果说明非加性遗传作用是玉米株高和穗位高的主要遗传基础。
3.基于QTL 互作网络，鉴定出居于网络节点bnlg1083、bnlg1811和umc1018 附近的3个QTL，它们可能在玉米株高和穗位高形成中起重要作用。