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MicroRNA是一类长度为22个碱基左右的,能够在转录后水平上调控基因表达的非编码RNA。最近的研究表明,病毒和宿主分别利用microRNA来实现免疫逃避或者免疫应答。使用microRNA调控基因表达对于病毒来说有着非同寻常的意义,可以使它们通过一种非免疫原性的方式调控胞内环境。通过microRNA调控自身和对方的靶基因从而实现病毒的存活策略和宿主的反制策略,构成了受microRNA调节的病毒与宿主互作网络的核心。宿主编码的microRNA可以作用于自身的转录物或者病毒的转录物,反之亦然。宿主的microRNA作用于病毒的靶基因是迄今为止研究最为透彻的microRNA介导的病毒防御机制之一。病毒的microRNA作用于宿主的转录物可以创造出比较适合病毒存活并复制的胞内环境。病毒编码的microRNA可以调节病毒自身的转录物,从而延迟疾病发生。由这些microRNA调控的宿主基因有可能在病毒潜伏过程中的病理生理学有关。对宿主和病毒在分子水平上的相互作用的研究有助于我们发现病毒潜伏感染的机制。根据miRBase发布的最新数据,有26个病毒物种能够编码microRNA,并且其中大部分是疱疹病毒科病毒。疱疹病毒科病毒是一类能够在动物中导致各种疾病,并能导致人类疾病的DNA病毒。疱疹病毒科包含3个亚科,17个属和90个物种。疱疹病毒极可能通过免疫逃避的方式建立终生感染。在本研究中,我们试图从非编码基因的角度阐释疱疹病毒和宿主的互作(病毒的免疫逃避和宿主的免疫应答)。通过预测靶基因和miRNA与mRNA互作网络分析探索microRNA在病毒与宿主互作中所扮演的角色。研究发现,病毒编码的miRNA主要通过抑制自身机构蛋白和一些比较重要的酶和调控蛋白,从而维持自身的潜伏感染,此外还会通过miRNA抑制宿主的凋亡,免疫应答并影响细胞周期。宿主的miRNA也可以抑制病毒结构蛋白和酶的翻译,此外宿主miRNA还可以调节自身的基因,分析表明在宿主中约有16%以上的转录物受自身miRNA的调控。