盐胁迫下甜菜M14品系根部膜的比较蛋白质组学研究

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盐胁迫是世界上影响植物生长、发育和产量的主要非生物胁迫之一。同时甜菜是双子叶藜科植物,有很高的经济价值。甜菜是一种抗盐作物,能在高盐条件下生存,是研究植物抗盐的绝好材料。甜菜M14品系是由栽培甜菜和野生白花甜菜杂交产生的,它含有栽培甜菜基因组和野生白花甜菜第9号染色体。研究证实甜菜M14品系保留了一些野生白花甜菜的优良特性,例如:抗盐性和无融合生殖等。植物细胞中有许多专门的执行特定功能的膜系统,包括质膜蛋白和各种细胞器结合的膜蛋白,膜蛋白作为植物细胞与外界环境物质交换和通信的接口,控制许多主要的细胞功能,如代谢产物,离子转运,囊泡运输等,盐胁迫下最先受到伤害的部位为膜,膜蛋白在植物抵御盐胁迫过程中起到至关重要的作用,膜蛋白的改变引起细胞形态的变化。因此,研究盐胁迫下膜蛋白抗盐机制有重要意义。本实验室前期已对甜菜M14品系叶片差异表达膜蛋白质进行分析。因此,本试验将利用iTRAQ技术对不同浓度NaCl(0、200、400mM)胁迫下甜菜M14品系根部膜蛋白质进行定量蛋白质组学分析,利用Proteome Discoverer软件将质谱信息与甜菜数据库信息进行比对搜索。对p<0.05的蛋白质进行分析,阈值大于2.0或者小于0.5的蛋白质定义为盐胁迫下甜菜M14品系根部差异膜蛋白质,同时分别作为上调和下调蛋白质的评判标准,得到73个差异表达蛋白质。为了进一步研究盐应答膜蛋白,将根部盐应答膜蛋白进行分类,分别是:运输(32%)、参与多种生物进程(10%)、信号转导(10%)、胁迫和防御(8%)、能量(8%)、降解(6%)、转录(6%)、代谢(5%)、合成(3%)、细胞结构(1%)和未知(11%)。结果表明,参与运输、信号转导和多种生物进程相关蛋白占较大比例。通过生物信息学分析发现鉴定的膜蛋白质多数定位在液泡膜、核膜、质膜、线粒体膜上。这些结果表明膜蛋白能够感知盐胁迫信号,传递信号,调节膜流动性及透性,调动各个细胞器膜蛋白共同作用抵抗盐份的侵害,建立新的平衡,本研究为进一步理解甜菜的抗盐机制奠定基础。
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