以采自锡林郭勒盟的黄花苜蓿为母本,塔什库尔干地区的紫花苜蓿为父本建立起了四倍体苜蓿的F2遗传家系。对此家系的花色、株型2个性状进行了描述,对株高、分枝数、主茎长、节间数、节间长、叶面积、叶周长、叶片长、叶片宽、叶片长宽比、叶型指数、鲜重、干重、粗蛋白、NDF(中性洗涤纤维)、ADF(酸性洗涤纤维)、粗灰分、粗纤维、粗脂肪、糖分、P元素、Ca元素等22个数量性状进行了遗传变异分析及QTL定位探索。　　 F2群体的花色和株型发生分离,农艺性状指标平均变异系数0.40,营养元素含量平均变异系数为0.16,小于农艺性状指标。对此家系构建的效果评价结果为:22个数量性状指标经检验基本符合正态分布,条形分布图均为连续的正态分布且具有广泛的分布频率,可以满足后续的QTL定位和方差分析。　　 用以共显性遗传为主的SSR、SRAP两种分子标记对家系进行了遗传图谱构建,获得了11个标记,共计14个位点的两个连锁群,位点数分别为4个和10个,连锁群长分别为97.32 cM和252.11 cM,覆盖图距349.43 cM,位点间平均距离24.96 cM。　　 单标记定位结果显示:有11个RAPD标记与18个性状相关联；有9对SSR引物检测与18个性状相关；SRAP引物与数量性状均无显著相关性。采用基于混合线性模型的复合区间作图法(MCIM)定位在22个数量性状中共检测到3个QTL位点,分别是中性洗涤纤维、粗纤维和糖分,均为营养成分指标,且影响3个性状的QTL位点都位于同一连锁群上(LG2),位置相近。