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Gankyrin(PSMD10)是近年来新发现的一个癌蛋白,由226个氨基酸组成,内含七个ankyrin重复序列,在结构上高度保守。Gankyrin是26S泛素蛋白酶体的调解亚单位,能够特异地结合19S调节子的S6b ATPase。
最初发现Gankyrin在多种肝癌细胞中高表达。初步研究表明Gankyrin在细胞内发挥多种功能,能够与RB发生相互作用,在体内和体外促进RB的泛素化降解;能够增强Mdm2的泛素E3酶活性进而促进Mdm2对P53的降解;能够与Cdk4结合,在细胞周期调控中发挥重要作用,拮抗p16INK4A和p18INK4C2的抑癌功能;还能与RelA发生相互作用,抑制NF-κB通路的活性。此外,在Ras转化的NIH3T3细胞中Gankyrin被显著上调,提示Gankyrin可能参与了Ras诱导的细胞转化过程。
上述研究提示Gankyrin参与了肿瘤细胞内多种信号通路。但目前国内外对Gankyrin功能的研究并不深入,Gankyrin在细胞生长、代谢、凋亡等生理过程中,尤其是在肿瘤细胞增殖、浸润、迁移过程中发挥的功能尚不清楚。为了探明Gankyrin在肿瘤的发生、发展、转移过程中的功能,寻找肿瘤细胞中Gankyrin参与的信号通路,本研究尝试利用高通量基因表达谱芯片技术,分析Gankyrin稳定干涉后SW480人结肠癌细胞中基因表达的变化,筛选出显著变化的基因,为深入研究Gankyrin的功能奠定基础。
本研究首先制备细胞样品,完成芯片杂交实验。随后应用多种数据分析方法,对芯片结果进行分析,筛选出78种显著变化的基因,并通过RT-PCR和Real-timePCR验证了其中部分基因,证实了芯片结果的可靠性。进一步对芯片结果进行了pathway分析,分析了Gankyrin发挥功能参与的信号通路。结果表明Gankyrin广泛参与了细胞内的多种生理/病理活动,特别是对肿瘤细胞增殖、迁移、侵润等多种通路都具有潜在的调节作用。
研究结果为深入探索Gankyrin的功能机制,尤其是Gankyrin在肿瘤细胞信号转导调控中的作用提供了依据和线索。