光温敏核不育基因的分布较为广泛，在不同的光温敏核不育系中表现出较大的差异性，在一定程度上表明光温敏核不育基因遗传的复杂性。本研究的目的是在前期的研究基础上，以HD9802S/两优287、两优287/HD9802S BC<,1>群体为材料，研究水稻温敏核不育系HD9802S不育性的遗传模式，利用SSR分子标记技术应用QTX软件分析作图，比较2，7号连锁群上雌雄配子重组值的差异以及对温敏核不育系HD9802S的核不育基因进行QTL定位，同时以HD9802S/R287F2群体为材料，利用SSR分子标记技术结合群分法找到与HD9802S核不育基因紧密连锁的分子标记，为进一步进行温敏核不育系HD9802S核不育基因的分离与克隆以及开展与HD9802S相关的分子标记辅助育种等研究奠定基础。研究结果如下： 通过对HD9802S/两优287、两优287/HD9802S BC<,1>群体和HD9802S/R287 F<,2>群体的花粉育性分析，对不育株和可育株的分离比进行卡平方测验，表明温敏核不育系HD9802S的不育性由 1 对主效隐性核基因控制，可能还受其他微效基因的影响。 运用QTX软件分析作图，结果表明：水稻 2 号连锁群上在标记RM279与RM5897、RM71与RM1358、RM1358与RM1313之间雄配子的重组值大于雌配子的；在标记RM5897与RMAN8、RMAN8与RM71、RMl313与RM5707之间雌配子的重组值大于雄配子的；水稻7号连锁群上在标记RM1134与RM8263、RM3635 与 RM7110之间雄配子的重组值大于雌配子的；在标记 RM6574 与RM501、RM501 与 RM3635、RM7110 与 RM11、RM11 与RM3743之间雌配子的重组值大于雄配子的；在标记RM8263与RM6574之间雌雄配子的重组值相等。从水稻温敏核不育系HD9802S不育基因的QTL定位结果来看，其育性QTL主效基因定位在2号染色体R_M5897与RMAN8区间内，在其它区间还有微效基因存在。在这个区域内，雌配子的重组值为5.4，HD9802S不育基因HDtms与标记RM5897的遗传图距为1.8cM，与标记RMAN8的遗传图距为4.0cM；雄配子的重组值为3.4，HD9802S不育基因HDtms与标记RM5897的遗传图距为0.9cM，与标记RMAN8的遗传图距为2.5cM。以两优287/HD9802S BC<,1>群体为作图群体可以提高作图精度，更适合作下一步的研究。同时通过群分法分析，不育基因HDtmsr 与这两个标记是紧密连锁的。在HD9802S/两优287 BC<,1>群体中7号染色体上，8对SSR标记均出现严重的偏分离现象(P <0.01)；在2号染色体上，引物RMAN8出现偏分离现象(P<0.05)。在两优287/HD9802S BCl群体中7号染色体上，引物RM1134，RM8263，RM6574，RM7110出现偏分离现象 (P<0.05)，引物RM501出现严重偏分离现象(P<0.01)。以上偏分离标记均偏向杂合型，其机制有待于进一步深入研究。