研究背景发热伴血小板减少综合征（SFTS）是一种新的出血性疾病,主要发生在丘陵和山区。患者多为从事农业生产的农民,部分患者有明确的蜱叮咬史。SFTS的主要临床症状包括发热、血小板减少、白细胞减少、胃肠道症状和各种其他症状,包括肌肉症状、神经系统异常和凝血障碍。李德新教授等人在2009年确定SFTS的病原体为严重发热伴血小板减少综合征病毒（SFTSV;一种新型布尼亚病毒）。在中国10多个省份发现了数千例病例,该病已在自2012年起在日本、韩国和其他国家报告。由于没有针对SFTSV开发出可靠的疫苗或有效的抗病毒药物,临床医生只能用利巴韦林和/或丙种球蛋白治疗这些患者,平均死亡率仍高达5.3-55%。SFTS患者的疾病严重程度通常与年龄和并发症如出血、神经损伤或呼吸衰竭等有关。日本患者SFTSV的死亡率似乎高于中国。此前,我们发现中国不同地区的病毒基因序列存在差异,致死率也存在显着差异。因此,病毒基因的序列差异可能导致通过病毒本身和/或病毒引起的免疫损伤的致病性差异。为了开发相关疫苗和/或获得用于主动或被动免疫治疗的中和抗体,有必要记录不同地区发生的SFTSV的遗传差异并找到合适的疫苗株。方法从NCBI上收集目前所有的SFTSV分离株完整序列。一共分为两个部分,从最初的时间到2017年7月为第一阶段。第一阶段的序列用于构建参照序列。自2017年8月至2018年1月为第二阶段。用做验证第一阶段参照株的分型。另外通过临床收集的发热伴血小板减少综合征患者的血清,提取患者血清RNA并送测序。将测序结果进一步验证分型,以便根据特异性突变位点,设计引物,鉴定基因分型。结果第一阶段一共纳入187个包含S、M、L三个片段的完整序列,排除其中的内部重组序列后,一共纳入174序列。相关病毒片段按照类似标准排除,合格的S、M、L片段序列分别为286株、81株、63株进入第二阶段。通过进化树分析和不同序列的成对比较对S、M、L片段进行分析,根据聚类分析和差异比较结果初步确定基因分型。具有明显聚类的病毒株直接归入同一基因型。对多组病毒片段进行聚类分析后,根据病毒株之间的同源性差异对其进行初步划分。不同的S、M、L片段病毒分别分为8、11和11个基因型。发现大多数菌株对三个片段具有相同的基因型,尽管9个菌株对两个片段具有相同的基因型,而对另一个片段具有不同的基因型。结论后续病毒株按照第一阶段分类方法进行基因分型,验证上述方法和基因分型标准的可靠性。结果表明,不同片段的每个基因型也可以区分。说明第一阶段建立的参照株是可行的。