PXK基因多态性与汉族人群系统性红斑狼疮易感性的关联研究

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研究背景:系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种可累及全身多种器官的自身免疫性疾病,其临床表现多样化,以自身抗体、补体激活、抑制性T淋巴细胞减少的自身反应性淋巴细胞增多及多器官损伤为特征。SLE的病因及发病机制尚未明确,目前认为与遗传、免疫、病毒感染、药物及激素等因素相关,其中遗传因素在SLE的发病中发挥重要作用。近年来随着国际单体图型计划(HapMap)的完成和高效的高通量基因分型技术的出现,全基因组关联分析(GWAS)已成为寻找复杂疾病易感基因最有效的方法。目前已开展了多个SLE易感基因的GWAS研究,发现了许多新的与SLE发生密切相关的基因,如I PXK、TGAM、KIAA1542、ETS1、IKZF1、RASGRP3、SLC15A4和TNIP1等[1]。其中Harley等[2]报道PXK基因的一个单核苷酸多态性(SNP)即rs6445975与欧洲人SLE易感性显著相关(P=7×10-9),但在香港、韩国及泰国等亚洲人群中未发现有相关性,存在争议。为进一步验证PXK是否与SLE易感性相关。本实验从近年国内外研究成果中选取PXK基因的7个SNPs进行研究,探讨PXK基因多态性与汉族人SLE易感性的相关性。目的:研究PXK基因多态性与汉族人SLE易感性的关系。方法:选取中国汉族569例SLE患者和533例正常对照样本采用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight massspectrometry,MALDI-TOF-MS)技术对PXK基因的7个单核苷酸多态性(SNP)进行基因分型。应用Haploview4.1软件、SPSS17.0软件和PHASE2.1软件进行系统分析。结果:1、 PXK基因的7个SNPs rs12486031、rs12629939、rs2138239、rs4075152、rs4681678和rs4681852在正常对照组人群中均符合HWE平衡定律(P>0.05),样本具有群体代表性;2、 SNP rs4075152位点的等位基因频率在SLE组和对照组间差异有统计学意义(P=0.046);3、PXK基因上其余6个SNPs(rs12486031、rs12629939、rs2138239、rs4681678、rs4681852和rs6445975)的等位基因频率在SLE病例组和对照组间差异无统计学意义(P>0.05);4、PXK基因的7个SNPs rs12486031、rs12629939、rs2138239、rs4075152、rs4681678、rs4681852和rs6445975连锁不平衡分析表明,发现这7个SNP之间互相高度连锁(D’>0.8);5、7个SNP的单倍型分析,发现单倍型GTCATTG在SLE患者及正常对照之间差异无统计学意义(P>0.05);而ACAGAAT这种单倍型在SLE患者及正常对照之间差异具有统计学意义(P=0.0027),提示ACAGAAT单倍型可能与SLE的易感性相关。结论:1、PXK基因的rs4075152多态性与汉族人SLE易感性的相关;2、PXK其余的6个位点rs12486031、rs12629939、rs2138293、rs4681678、rs4681852和rs6445975的多态性未发现与SLE的易感性相关;3、对7个SNPs进行连锁性分析,发现它们之间存在高度的连锁不平衡性;4、7个SNPs的单倍型分析提示ACAGAAT单倍型可能与SLE的易感性相关。
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