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绍兴鸭作为我国优异种质资源,以其产蛋量高而闻名于世。目前在蛋鸭育种实践中,往往以产蛋性状为主要选育目标,而往往忽视蛋鸭生长及发育性状,特别是种公鸭,如果公鸭的生长及发育被影响,会使公鸭配种价值提早丧失,而且易造成低受精率,往往会大大降低种鸭的经济效益。基于这一现状,本研究首先对绍兴鸭体重与体尺性状指标进行了主成分分析,再选择与生长发育密切相关的两个候选基因PPARγ基因和GH基因,通过直接测序方法扫描其SNP位点,并分析其与生长性状和屠体性状的关联性,结果表明:(1)对绍兴鸭9个体尺性状和体重指标进行测定,并分别选择公母鸭累计贡献率达50%的主成分进行分析。从主要成分的特征根和贡献率来看,体重、体斜长、龙骨长、半潜水长和胫长对主成分的贡献率最大,建议今后对绍兴鸭的体型性状进行选育时至少应包括以上5个指标。(2)采用直接测序方法对绍兴鸭PPARγ、GH的SNP位点进行扫描,在PPARy基因的8169A>C、GH基因的2514G>A和2691T>C处检测到3个SNP位点,且三个座位均处Hardy-Weinberg平衡状态。(3)最小二乘法分析表明,PPARy基因(8169A>C)的AC基因型个体的8周龄体重显著高于CC基因型个体(P<0.05),CC基因型个体12周龄半潜水长、53周龄胫围显著高于AA基因型个体(P<0.05);GH基因(2691TT基因型个体6周龄体重、8周龄体重、12周龄龙骨长、53周龄胸宽显著高于CT基因型个体(P<0.05)。TT基因型53周龄胸肌重、腹脂重、腹脂率显著高于CT和CC基因型个体(P<0.05)。