新的《中华人民共和国企业所得税法》与《中华人民共和国企业所得税法实施条例》于2008年1月1日起施行,作为税收政策的重要组成部分,新法体现了对高新技术企业发展的政策支持,鼓励公平竞争和技术创新。企业所得税制改革必将对高新技术企业产生一系列的影响与效应。由于新企业所得税法与实施细则公布时间短,新法对高新技术企业产生的效应研究还基本处于空白。本论文在研究的过程中,从高新技术企业微观主体出发,将经典资本结构理论、税收对公司投资决策影响的新古典模型理论、扩大再生产理论等西方经济学理论,与中国所得税税制改革的具体实际相结合,并注重因素分析法与实证分析方法的运用。我们发现:所得税制改革对高新技术企业产生效应主要体现在对资本结构、投资行为、扩大再生产等几个方面,新企业所得税法的实施缩小了不同性质、不同区域、不同行业高新技术企业的税收差异;资本结构因债务税盾效应会有所改变;对投资来讲,区域经济发展的差异性将得到有效校正,长期投资将会得到进一步的重视,利用外资的质量将会得到进一步加强;在高新技术企业扩大再生产中,对其产品研发与技术创新、人力资本的提升、固定资产改造和相关经济行为都会产生积极的影响。通过对48家上市高新技术企业建模测度出这些因素对高新技术企业价值提升的激励效应,并在此基础上,针对政策执行存在的问题,提出优化和完善新企业所得税的建议。