基于DHPLC的遗传性耳聋基因突变检测平台的建立和应用

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近十多年来遗传性耳聋的研究进展迅速,目前一共定位了120多个非综合征性听力损害(nonsyndromic hearing loss,NSHL)相关位点,克隆了41个基因,体现了NSHL的高度遗传异质性。目前常用的突变检测方法只能为耳聋患者进行少数最常见疾病相关基因的检测,大部分的NSHL患者得不到确诊,也很难满足广大耳聋患者进行遗传咨询的需要。最近许多研究报道了变性高效液相色谱(Denaturing High Performance Liquid Chromatography,DHPLC)技术在突变检测中具有高效性、高通量、低成本和操作方便简易等许多优点。本研究旨在利用DHPLC的这些特点并结合测序来建立遗传性耳聋基因突变检测的技术平台,提高耳聋患者致病基因的检出率,更好的为这些患者提供遗传咨询,并通过产前诊断减少耳聋患儿的出生。本课题先选择最常见的耳聋致病基因GJB2进行突变筛查,在成功建立DHPLC突变筛查技术平台的基础上,选择两个具有一定临床特征的耳聋基因COCH和WFS1进行突变筛查。通过DHPLC结合测序,16个遗传耳聋家系得到明确的基因诊断:检测到15种不同类型的GJB2变异(包括7种突变和8种多态),7种COCH变异(包括1种未知突变,1种未知多态和5种已知多态),19种WFS1变异(包括1种已知突变,1种性质待定的变异,2种未知多态和15种已知多态)。GJB2突变是导致学语前隐性遗传性耳聋的主要原因,在本研究中28.6%的学语前隐性和20.7%的学语前散发耳聋患者携带两个GJB2等位基因突变,但这一比例要明显低于欧美人群中的50%;235delC为最常见的突变类型,占所有GJB2突变的76.3%;另外发现79G>A、109G>A和341A>G是中国人群最常见的三种多态,等位基因频率分别为21.3%、9.6%和17.8%。COCH突变主要与呈常染色体显性遗传的进行性听力损害并伴有前庭功能障碍的耳聋高度相关。WFS1突变则在呈常染色体显性遗传的低频听力损害患者中较常见。根据特征性临床表现并对这些含有多个外显子的NSHL基因进行突变筛查,DHPLC是一种有效的方法。而在中国人群中因GJB2多态等位基因频率非常高,所以GJB2不适合用DHPLC进行筛查。
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