小黑杨茎和叶的基因差异表达分析

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小黑杨(Populus simonii×P.nigra)是小叶杨与欧洲黑杨的杂交种,其生长迅速,材质优良,木材广泛用于造纸和板材加工。本研究为明确小黑杨茎和叶的基因表达差异,了解其木材形成机制,利用cDNA-AFLP技术对小黑杨茎和叶的差异表达基因进行了分析。结果表明,用64对红外激光标记引物组合在茎和叶中扩增出4192条基因片断,茎叶差异表达基因片段2275条,其中叶中特异表达基因片段1236条,茎中特异表达基因片段1039条。用银染法观察到402条茎叶差异表达基因片段,经片段回收、克隆和测序,获得217条唯一序列,GenBank登录号为:JG567410-JG567590和GW863844-GW863890。通过Blast-x比对发现165条基因片段与已知基因同源,25条基因片段编码未知功能蛋白,27条基因片段没有与之匹配的已知基因序列。根据基因序列的功能注释和相关参考文献,将166条功能已知基因序列划分为新陈代谢、木质素合成、运输、维管束聚合、细胞壁合成或降解、纤维素合成、分解代谢、转录、信号传导、蛋白质生物合成、光合作用和其他功能等12类。通过生物信息学分析发现,S-03号片段是与木质素合成相关的漆酶基因,用RT-PCR技术对杨树漆酶cDNA片段进行克隆,获得了1413 bp包含开放阅读编码框的小黑杨漆酶基因片段PsnLAC,其开放阅读编码框长度为1020 bp,编码339个氨基酸残基,与来自其他植物漆酶的氨基酸序列具有较高的同源性。以烟草叶片为外植体,利用农杆菌介导法将小黑杨漆酶基因PsnLAC导入烟草基因组。PCR和RT-PCR检测表明,外源PsnLAC基因已经整合到烟草基因组中,转PsnLAC基因烟草与非转基因植株相比,茎段总木质素含量增加,植株耐盐胁迫能力提高。
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