更新世时期的气候变化及近期的人类活动是塑造和改变当前大多数物种遗传结构和遗传多样性的主要因素。但是，同时结合考虑这两种因素的研究还很缺乏。大仓鼠(Tscherskiatriton)是广泛分布在中国北方的一种重要的，适应于人类农业生态的鼠种，我们用2个线粒体DNA基因序列和11个核DNA微卫星位点作为遗传标记，在大仓鼠分布范围内采集41个种群，通过构建系统谱系，分析遗传结构及遗传多样性以及种群动态变化历史来区别晚更新世时期最后一个冰期循环和近期农业发展在决定大仓鼠遗传多样性和结构上所发挥的不同作用。通过生态位模型预测三个时期大仓鼠的潜在分布区：现在，末次大冰期(LGM，～21000BeforePresent)及末次间冰期(LIG～116000BeforePresent)，来分析大仓鼠在最后一个冰期的分布变化。由生态位模型结合系统谱系结构产生大仓鼠可能的历史进化假设，在统计框架下，用溯祖模拟检验。　　系统谱系分析结果显示，山东烟台的一些个体以很远的进化距离和其他群体的分歧，种群之间的近期分歧和不完全谱系分拣(incompletelineagesorting)导致了地理区域内的种群不能形成单系群，但细胞色素b基因的网络树和微卫星推测的遗传簇都支持了西北，华北和东北地理遗传格局的存在。比较不同遗传标记的遗传变异结果则表明，西北地区大仓鼠种群是近期形成的，华北地区种群受近期人类活动影响较大。种群的历史动态分析说明大仓鼠在过去的120000年内经历了末次冰期的数量增长和近期的快速下降，结合生态位模型，都反映了大仓鼠种群变化和这时间段内气候之间的关系。对历史进化模型的检验，支持了大仓鼠种群近期分歧的结论。由气候变化驱动的大仓鼠分布扩增和收缩，以及地理阻隔效应的作用决定了大仓鼠现在遗传格局的主要特征。