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辣椒在栽培过程中经常遭受不同病原物的为害，并导致产量和品质下降。本研究对辣椒中控制茉莉酸抗病信号途径中的关键调控因子COI1基因(CaCOI1)的cDNA部分序列的特征进行了分析，推测出其可能编码的氨基酸序列，并设计了一对引物，利用PCR技术以辣椒基因组DNA为模板，扩增得到一条约1200bp的条带，将该条带克隆到T载体中，测出其长度为1157 bp，确认了该基因存在于辣椒基因组中。通过对CaCOI1基因在辣椒不同部位的表达水平的分析，发现CaCOI1在辣椒的叶、茎和根部都有表达，其中在叶部表达最活跃。运用RACE技术，克隆了CaCOI1基因cDNA3末端445bp长度的序列。最后，与其它物种的COI1基因进行了比较，用不同物种COI1蛋白的氨基酸构建了系统进化树，发现辣椒与番茄和烟草COI1形成一个小的分支；但是辣椒与番茄COI1的距离比较远，即这两个物种的COI1分歧比较大。而水稻COI1单独形成一个分支；推测认为，COI1基因在双子叶和单子叶植物发生分歧时就开始分化变异。本研究为最终克隆CaCOI1基因全长cDNA序列及阐明该基因在辣椒抗病性中的作用奠定了基础。