本文从历史和比较的角度对公司治理结构理论和实践进行了探讨，重点研究了我国经济转轨时期国有企业治理结构存在的问题，并为目前我国国有企业治理结构的改革提供指导。转轨时期及国有公共产权的特点决定了我国国有企业的治理结构不同于西方市场经济背景下的公司治理结构，代理成本高、监督不到位、激励约束机制不完善等是国有企业治理结构的主要特点。股权结构不合理，股东会形同虚设；董事会结构失衡；监事会缺乏独立性，监督失效；企业董事会和经理层的责任混淆等则是公司治理结构存在的主要问题。这些特点和问题的根本原因在于所有者的缺位。因此改革的思路就是要明晰产权，建立合理的产权制度是建立有效公司治理结构的决定性基础，也是解决所有者缺位的关键所在。在目前的约束条件下，完善国有出资人到位制度，建立多元化的产权主体是一种现实的选择。