基层治理现代化是国家治理现代化的重要组成部分，农村实现治理现代化也是基层治理面临的重要命题。国家管理理念已经转变为治理理念，十九大以来，党和政府不断强调发挥基层政府的指导作用，呼吁基层社会多方主体协调参与，实施创新型治理方式。当前农村采用村民自治，其显现出复杂多样的问题，治理手段还不够健全，故而在村民自治中需要发挥软法治理的功能，完善村民自治的多元治理方式，推进国家治理体系和治理能力现代化。对此，文章从村民自治和软法治理的基本概念入手，界定了村民自治和软法治理的概念，阐释了村民自治的构成要件、主要内容、方式以及原则，在村民自治和软法治理理论的基础上，论证了村民自治和软法治理之间的关系，从历史的角度纵向分析了村民自治的软法治理的发展，阐述了软法治理在村民自治中的主要表现形式，即村规民约、村民自治章程、村民事务的具体规则，为村民自治的软法治理的展开提供依据;其次从多学科交叉的角度上剖析了村民自治的软法治理的理论基础，挖掘村民自治的软法治理在乡村治理中的价值，即有利于实现“良法善治”的目的，有利于发挥本土资源的效果，有利于实现治理体系和治理能力现代化的目标;在此基础上着重分析了村民自治的软法治理存在的问题，即民主性缺失与制定程序不合理，仅依靠“软约束力”难以定纷止争，软法与硬法相冲突，软法与硬法衔接不当，村两委与乡镇政府之间关系错位，缺乏有效的监督，司法救济不足;最后，针对上述村民自治的软法治理的不足提出完善的建议，即深化民主理念，加强公众参与，注重权利保护，规范制定程序;完善软法与硬法的衔接机制，理清村委会、党支部和乡镇政府之间的关系，健全监督机制，完善司法救济途径，通过软法与硬法共治的方式，最终实现国家治理现代化的目标。