在我国的国家创新体系中,国家站在战略的高度来规划科学技术创新活动,科技计划项目作为我国科技计划落实的具体载体,在推动科技发展、提高我国的科技竞争力方面有着越来越重要的作用。在国家科技计划项目的管理实践中,立项、结项等方面有相对应的管理政策与办法,呈现出全面而系统。然而针对项目的实施管理过程则缺乏有效的政策支撑和方法论工具,造成项目管理工作缺乏有效的政策支撑,监管的措施往往不能到位。国家科技计划项目的实施过程,作为达成项目目标的关键步骤,对国家科技计划项目实施过程的管理则是保证项目取得成功的重要过程。因此,在国家科技计划项目启动之后,进入到项目的实施阶段中,运用科学的管理工具和管理的方法来管理整个项目是及其重要的。罗宾斯认为管理人员应做好计划、组织、领导和控制四项工作。做好计划是做好项目管理工作的基础,因此,本文从项目负责人的计划管理职责出发,来探究项目负责人如何做好项目实施过程的管理工作。通过分析国家科技计划项目的特点以及管理模式,界定了项目负责人的内涵,在此基础上,基于逻辑框架法构建了国家科技计划项目的三级计划管理模式,包括计划的分级和项目负责人的计划管理职责以及项目计划的要素框架,并将此项目的三级计划管理体系应用到实践中,进行实证研究,已验证该体系的有效性。作为对国家科技计划项目的实施过程管理的工具和手段,三级计划管理体系的作用很重大,提供了管理的模式并创新了计划管理的综合性,能保证国家科技计划项目的顺利实施。