猪HSD17B1、NR4A1、ALAS1基因的分离、鉴定及功能初步研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nqwei
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
繁殖性能尤其是产仔数在猪生产中具有重要的经济意义,但由于产仔数是低遗传力的性状,仍需从生理生化机理和分子水平方面来研究其基因效应。本试验通过生理生化功能和对卵泡发育、成熟和排卵过程的分子机制的了解,选取HSD17B1、NR4A1和ALAS1基因做为影响猪繁殖性状的候选基因。运用比较基因组学和生物信息学方法对候选基因进行了分离、鉴定;应用RT-PCR方法对基因进行表达模式分析;在不同猪种中进行基因序列比对,寻找SNPs,并进行基因的多态性与猪繁殖性状关联分析;对基因的启动子功能进行初步研究。取得的研究结果如下:1.HSD17B1(17beta-Hydroxysteroid dehydrogenase type 1)基因(1)首次获得猪HSD17B1 DNA序列1936bp,其中包括18bp的5’非编码区序列、966bp的CDS序列和所有内含子序列及21bp的3’非编码区序列;(2)对猪HSD17B1基因的结构、编码的蛋白质的特征进行分析和预测,发现其具有SDR家族的保守特征序列“Gly-X-X-X-Gly-X-Gly、Tyr-X-X-X-Lys、Ser134”及存在一个保守结构域:短链脱氢酶,进而验证了所分离的基因的正确性;(3)用RT-PCR方法分析猪HSD17B1基因的时空表达模式,结果表明,在卵巢组织中特异表达;在性腺激素处理卵巢颗粒细胞后,发现可诱导猪HSD17B1基因在卵泡发育和排卵时期瞬时表达;(4)通过比较序列测定法,在第4内含子253bp处发现的A/C突变,建立了PCR-MvaI-RFLP分型技术,并在4个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率;(5)在大白猪和中国瘦肉猪新品系DIV猪群中检测该位点的多态性与繁殖性状进行关联分析,结果表明,MvaI多态位点与DIV系猪的头胎产仔数和所有胎次产活仔数显著相关(P<0.05),加性效应显著(P<0.05);与大白猪的所有胎次产活仔数显著相关(P<0.05),加性效应显著(P<0.05);(6)采用两次TAIL-PCR方法将序列拼接共获得猪HSD17B1基因转录起始位点上游的852bp启动子序列。通过生物信息学分析所获得的上游序列,发现有两处存在雌激素受体(Estrogenreceptor,ER)结合位点;7)利用启动子缺失和定点突变ER结合位点的方法共构建了7个重组质粒,转染PK15细胞后,结果表明它们的活性没有显著差异,可能是由于转录因子ER没有结合到猪HSD17B1基因的启动子上造成的;(8)利用Genbank中提供的猪ER基因的序列信息,分离了ER DBD(Estrogen receptor DNAbinding domain)区域序列,并构建了PCNDA3.1(+)真核表达质粒载体,将其质粒分别与构建好的7个重组质粒在PK15细胞中共转染,结果表明,当ER DBD区域结合到HSD17B1基因的启动子上时,可增强其启动子活性。2.NR4A1(Nuclear receptor subfamily 4,group A,member 1)基因(1)首次共获得猪NR4A1 DNA序列4870bp,其中包括99bp的5’非编码区序列、1734bp的CDS序列和所有内含子序列;(2)对猪NR4A1基因的结构、编码的蛋白质的特征进行分析和预测,发现该蛋白的氨基酸序列非常保守,并且还存在两个保守结构域:激素受体超家族和Zf-C4,进一步验证了所分离的基因的正确性;(3)运用RT-PCR方法分析猪NR4A1基因的时空表达模式,结果表明,除了胃组织外,在其他组织中都表达;在性腺激素处理卵巢颗粒细胞后,可诱导猪NR4A1基因在卵泡发育,破裂排卵和黄体化时期瞬时表达;(4)通过比较序列测定法,在第5内含子796bp处发现的A/G突变,建立了PCR-DdeI-RFLP分型技术,并在4个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率;(5)在大白猪和中国瘦肉猪新品系DIV猪群中检测该位点的多态性并与繁殖性状进行关联分析,结果表明,DdeI多态位点与DIV系猪的头胎产仔数显著相关(P<0.05);与大白猪的所有胎次产活仔数和产仔数显著相关(P<0.05),加性效应显著(P<0.05)。3.ALAS1(5-aminolevulinate synthase 1)基因(1)首次共获得猪ALAS1 DNA序列9137bp bp,其中包括53bp的5’非编码区序列、1922bp的CDS序列和2-9内含子序列;(2)对猪ALAS1基因的结构、编码的蛋白质的特征进行分析和预测,发现该蛋白的氨基酸序列非常保守,存在一个天东酰胺转氨酶超家族(AAT-1)保守结构域,进而验证了所分离的基因的正确性;(3)运用RT-PCR方法分析猪ALAS1基因的时空表达模式,结果表明,在所有检测的组织中都表达;在性腺激素处理卵巢颗粒细胞后,可诱导猪ALAS1基因在卵泡发育,破裂排卵和黄体化时期瞬时表达;(4)通过比较序列测定法,在第9内含子257bp处发现T/C突变,建立了PCR-MspI-RFLP分型技术,并在4个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率;(5)在大白猪和中国瘦肉猪新品系DIV猪群中检测该位点的多态性并与繁殖性状进行关联分析,结果表明,MspI多态位点与DIV系猪的头胎产仔数和所有胎次产仔数显著相关(P<0.05),加性效应显著(P<0.05);与大白猪的所有胎次产活仔数和产字数显著相关(P<0.05),加性效应显著(P<0.05)。
其他文献
2019年12月25日,中国文学艺术界联合会、中国民间文学大系出版工程(以下简称“大系出版工程”)领导小组在北京人民大会堂隆重举行了大系出版工程首批成果发布会。中国文联党
本文运用文集、方志、报刊、档案等多种史料,结合田野调查,试图从明清以来福州的自然环境、市场网络和民间宗教、地方权力等角度,探讨近代福州市民在社会变迁和局势动荡情况
吕祖谦是我国南宋时期“婺学”的创始人,著名的儒学大师。他提倡“矫正气质论”的教育价值论、“明理治心”的德育目标和“经世致用”的智育目标,并提倡教师上德论和学生学习
随着社会的发展以及经济发展,传统模式下的水文监测方式已经无法满足时代的发展需求,伴随着测验设施和对应能力的提升,就可以做好水文监测的有效改革,这样才能够找准改革之中
介绍了中山大学附属第一医院构建经济活动内部控制长效运行机制、多方位完善医院经济活动内部控制体系的实践探索。并针对经济活动中内控评价机制不完善、廉洁风险难以防控的
摘要:道德两难困境的出现导致知行不一现象的发生,而道德两难困境的形成则是道德、行为主体和社会多种因素综合作用的结果。化解道德两难困境、实现知行合一,要正确看待道德两难困境问题,作好面对道德两难困境的思想准备;总结借鉴成功经验,提高行为主体化解道德两难困境的综合能力;多措并举,营造化解道德两难困境的社会氛围。  关键词:道德两难;知行不一;知行合一  中图分类号:B82 文献标识码:A 文章
采用GB 5009.3-2016《食品安全国家标准食品中水分的测定》方法中首法暨仲裁法测定水分含量,对测定玉米水分结果的不确定度进行评定,分析计算测量结果不确定度分量。分析了测
目的:探讨腓骨颈截骨入路切开复位钢板内固定治疗胫骨平台后外侧骨折的临床疗效和安全性。方法:2013年6月至2016年6月,采用腓骨颈截骨入路切开复位钢板内固定治疗胫骨平台后
小组合作学习法在当今课堂教学中被广泛运用。因为它既能培养学生的主观能动性,又能提高学生观察、判断和分析事物的能力,特别在语文阅读教学中,该学习法有着突出的展现。本