猪Myf-5基因和L-FABP基因的遗传多态性及其与胴体和肉质性状间关联性研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zippomu
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MyoD(Myogenic detemination gene)家族因子在骨骼肌的发育中起重要的调节作用,它可以激活肌肉相关基因的转录,促进肌纤维细胞的分化。脂肪酸结合蛋白(fatty acid-binding proteins,FABPs)家族参与细胞内脂肪酸的摄取、转运以及甘油三酯和磷脂的合成。本研究应用PCR-SSCP方法分析了329头个体生肌决定因子5(Myf-5)和肝脏型脂肪酸结合蛋白(L-FABP)基因的多态性,并探索它们对雅南猪、大河猪、大乌猪、长雅猪(长白×雅南)以及DLY猪(杜洛克×长白×大约克)的胴体和肉质性状的遗传效应大小,结果如下:Myf-5基因引物M1扩增片段,通过测序结果和Myf-5基因的参考序列比对,总共检测出5个点突变,第2335位C→A、第2342位A→G和第2370位G→A位于外显子2,第2395位C→T和第2425位A→G位于内含子2。结果分析发现大乌猪没有A等位基因,约克夏猪没有B等位基因,大河猪没有C等位基因,雅南猪、长雅猪、DLY猪没有D等位基因。只有藏猪和PIC猪同时检测到四种等位基因。从所有的检测个体来看,四种等位基因中C等位基因频率最具优势。通过关联性分析发现基因型AB表现更高的瘦肉率,更低的大理石纹评分。基因型AC眼肌面积最小,平均背膘厚最高,同时pH2值最低。基因型BB有助于改善大理石纹评分,增加IMF含量。基因型CC表现为增加pH2的值。Myf-5基因引物M2扩增片段,通过测序结果和Myf-5基因的参考序列比对,总共检测出1个缺失和1个点突变,即第3387位A的缺失和第3502位A→C的点突变,这2个位点均位于第3外显子。结果分析发现约克夏猪只有H等位基因,其余猪群均检测到G和H两种等位基因。在所有猪群中,除雅南猪外的其余七个猪群中H等位基因频率均大于G等位基因频率,可以看出H等位基因占绝对的优势。通过最小二乘分析发现,基因型GH表现为增大眼肌面积,降低平均背膘厚,与眼肌面积存在一定程度的正相关,与平均背膘厚存在一定的负相关。在肉质性状上基因型GG有助于增加IMF含量。L-FABP基因引物L2扩增片段,通过测序结果和L-FABP基因的参考序列比对,检测出第2128位T→A的突变,第2145位G的缺失和第2158位A→G的突变,这3个位点均位于L-FABP基因第3内含子。结果分析发现除雅南猪和长雅猪外,大河猪、藏猪、约克夏猪、大乌猪、DLY和PIC猪均检测到R和T这两种等位基因,其中T等位基因频率较R等位基因频率更具有优势。通过对L-FABP基因引物L2基因型与群体IMF含量进行关联性分析,发现三种基因型RR、RT、TT的IMF最小二乘均值差异不显著。与其它胴体和肉质性状分析发现基因型TT可增大眼肌面积,降低平均背膘厚,使pH2变大。
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