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棉花是我国最重要的经济作物之一,干旱一直是制约棉花生产发展的关键因素。为快速高效鉴定陆地棉品种的抗旱性,本文以191份陆地棉栽培种构成的自然群体为实验材料,在萌发期和花铃期分别对其进行干旱胁迫,利用74对SSR引物对该自然群体进行基因组扫描分析,利用关联分析技术寻找与抗旱性相关联的标记位点,以期为棉花抗旱分子辅助选择育种奠定基础。本文以花铃期为主要研究时期,调查包括产量在内的7个农艺性状以及5个纤维品质性状,以抗旱性度量值为主,结合综合抗旱系数、抗旱指数,对棉花的抗旱性进行综合评价。筛选出7份抗旱型材料,主要包括新陆中36、中ZZS-34、中ZZS-41、SGK321、30741、中ZZS-18、国欣棉11号等。利用74对均匀分布于染色体的引物对该自然群体进行基因组变异扫描,检测到246个等位变异,涉及147个多态性位点;群体结构分析将材料分为2个亚群,分别包含123份和68份材料。利用MLM(Mixed linear model,混合线性模型)对萌发期发芽率、综合抗旱系数、抗旱性度量值进行关联分析,P<0.05时检测到35个标记位点,P<0.01时检测到15个标记位点。检测到与抗旱性度量值和综合抗旱系数显著相关的标记位点6个,即NAU3017-1、NAU3468-2、NAU5233-1、SWU10214-2、NAU5351-2、NAU3096-2;与抗旱性度量值和发芽率显著相关的标记位点4个,分别为BNL3452-1、NAU3419-1、NAU2265-1和BNL3469-1。利用MLM对花铃期12个表型性状、综合抗旱系数、抗旱指数、抗旱性度量值进行关联分析,在P<0.05时检测到的关联位点122个。27个标记位点与12个表型性状中两个或两个以上的性状相关联;能同时在三个抗旱评价指标下检测到的标记有一个:NAU5163-1,标记NAU3424-2与抗旱性度量值和综合抗旱系数相关联,6个标记位点在与抗旱性度量值关联的同时与抗旱性状相关联,分别为NAU5064-2、NAU980-1、NAU5064-1、NAU980-2、NAU2980-2、NAU5428;5个标记位点同时与抗旱指数和抗旱性状关联,分别为NAU3017-2、NAU3468-1、NAU4042-1、SWU10054-2、SWU10056-1。