基于高通量测序技术研究乳腺癌患者ctDNA特征并探索其在诊断中的潜在应用价值

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背景:乳腺癌是女性的首位发病的恶性肿瘤,最近文献报道指出,2015年中国女性乳腺癌发病人数高达30.4万[1]。早诊治很可能是减少人类癌症死亡率最有效的手段。钼靶及乳腺彩超检查是临床常用的乳腺癌筛查手段,然而仅依赖影像学检查,有时难以辨别肿瘤的性质,在临床实践中需通过有创的穿刺病理或手术病理检查辨明肿物性质。同时需引起注意的是,临床上大量的不能触及的乳腺恶性肿物被漏诊,延误乳腺癌的诊治,导致不良的预后。循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA),即肿瘤原发灶、血液中及转移灶的肿瘤细胞通过坏死、凋亡或直接分泌等方式,向血液中释放的游离DNA片段。ctDNA理论上存在于癌症患者的体中,而不存在于良性肿瘤患者、健康人体中。ctDNA检测能克服肿瘤的异质性,具有即时性、无创性、方便获取等特点,成为体液活检技术的研究热点。有文献报道,ctDNA检测可先于影像学检测出肿瘤的复发及进展。然而,早期乳腺癌病人血液的ctDNA含量极低,其ctDNA检测一定程度上受到技术的限制,医学工作者通过ctDNA检测早于影像学检查发现原发癌灶存在技术难点。本研究使用以超高灵敏度、超高测序深度为特点的高通量测序技术,检测乳腺癌患者及良性乳腺肿物患者的术前血浆ctDNA,分析受试者的ctDNA特征,探索血浆ctDNA检测在乳腺癌诊断中的潜在价值。方法:用高通量测序技术检测6例乳腺良性肿瘤患者的术前血浆ctDNA,以及21例乳腺癌患者的术前血浆ctDNA及肿瘤组织DNA,检测62个乳癌相关基因的突变情况。主要分析该技术检测ctDNA的灵敏度、特异性及乳腺癌患者的术前血浆ctDNA及其肿瘤组织DNA基因突变的一致率,并分析ctDNA与肿瘤组织DNA突变的分布特征。结果:本实验共入组27例受试者。入组的6例乳腺良性肿瘤患者中1例患者的术前血浆检测出ctDNA;入组的21例乳腺癌患者中16例患者的术前血浆测出ctDNA。本研究检测技术检测出ctDNA的灵敏度为76.19%,特异性83.33%。乳腺癌患者血浆ctDNA的突变与肿瘤组织中组织DNA的突变一致率为23.81%。本实验肿瘤组织DNA检出频率最高的3个突变基因依次为TP53、PIK3CA、PTEN;术前血浆ctDNA检出频率最高的3个突变基因依次为TP53、ATM、BRCA2。结论:使用高通量测序技术可从乳腺癌患者术前血浆中检测出ctDNA,恶性组患者的血浆ctDNA检出率明显的高于良性组,在良性、恶性患者中检测ctDNA有较高的敏感度和特异性。通过用高通量测序技术可在乳腺癌患者血浆检测出乳腺癌相关基因的突变,但与肿瘤组织DNA的一致率还有待提高。本研究数据表明,高通量测序技术检测ctDNA应用于乳腺癌诊断有潜在的可行性。但ctDNA检测作为一个无创性肿瘤筛查的检测手段,还需更合理的基因组合嵌板及更精准的ctDNA检测技术。
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