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平舟原缨口鳅(Vanmanenia pingchowensis)和海南原缨口鳅(Vanmanenia hainanensis)隶属于鲤形目(Cypriniformes)平鳍鳅科(Homalopteridae)腹吸鳅亚科(Gastromyoninae)原缨口鳅属(Vanmanenia)。该属鱼类是一类在山间溪流和江河中上游等急流环境中栖息的小型淡水鱼类。 平舟原缨口鳅主要分布于华南大陆地区，海南原缨口鳅分布于海南岛，这两个种之间的鉴别特征不明显，极为相似，相互重叠，形态学划分和描述上的模糊与疑问，使得平舟原缨口鳅与海南原缨口鳅的亲缘关系和地理进化分析显示出重要的价值。 本文对采自华南地区和长江南侧支流的14条水系(包括珠江水系的北江、东江、西江各支流和长江水系的湘江、赣江及沅江)的平舟原缨口鳅和海南昌化江的海南原缨口鳅的细胞色素b(Cytb)基因序列进行了测定分析，并结合形态测量对其种群变异与地理分化进行研究。通过研究，得出了以下结论： 1.通过对14条水系108尾平舟原缨口鳅和8尾海南原缨口鳅共116尾样品的Cytb基因进行分析，发现共有279个核苷酸变异位点，定义了49个单倍型。单倍型多样性为0.971，核苷酸多样性为0.04522，表现出丰富的遗传多样性和较高的进化潜力。 2.基于Cyt6基因的分子系统树分析，这14条水系分为2大支系(Ⅰ和Ⅱ)。珠江水系的东江、北江、西江各其支流(桂江、柳江、浔江、樟江、漓江)和海南岛水系的昌化江以及长江水系的湘江(灵渠)和洞庭湖水系的沅江的部分个体聚合成了分支Ⅰ，长江鄱阳湖水系赣江的种群和洞庭湖水系沅江的一部分个体聚合成了分支Ⅱ； 3.49个单倍型所组成的网络图结构与系统发育树结构表现出较高的一致性，这14条水系的原缨口鳅种群可分为2个大的地理支系。第一支为珠江水系、海南岛水系及长江水系的一部分，第二支为长江水系。 4.分子变异分析(AMOVA)表明，地理区内种群间的分化指数高达0.88058(p<0.001)，说明这两种原缨口鳅同一地理区内不同水系的种群间存在很大程度的分化；地理区间分化指数为0.19273，说明这两种原缨口鳅在地理区间种群间的分化较小。错配分布分析和中性检验都表明，这14条水系的平舟原缨口鳅和海南原缨口鳅在整个种群上保持相对稳定，没有发生明显的种群扩张。 5.对采自华南地区166尾平舟原缨口鳅和海南岛昌化江的51尾海南原缨口鳅总计12条水系217尾标本进行测量。可量形状的主成分分析表明，整个平舟原缨口鳅种群的形态变化不大，较为稳定，只有昌化江的海南原缨口鳅种群与东江的甲舟原缨口鳅种群出现了一定的形态差异。 结合形态学和DNA序列分析结果，认为长江水系和珠江水系的平舟原缨口鳅虽然已有相当程度的分化但也曾有过一定程度的基因交流；平舟原缨口鳅和海南原缨口鳅的亲缘关系密切，差异较小，二者尚未达到物种的分化水平。