品种的真实性和纯度是种子检测最重要的指标之一，而研究快速、准确、简便的ＤＮＡ分子标记技术鉴定甜菜种子和将来新品种授权均具有重要的意义。本研究首次利用SSR分子标记对我国生产上应用的甜菜品种进行指纹图谱的构建，同时对影响品种纯度和真实性鉴定的各种因素进行系统的分析，建立了一套快速、高效的品种纯度和真实性鉴定方法，使快速鉴定甜菜品种及不同实验室的交流成为可能。主要结果如下：1.建立了快速高效提取甜菜基因组DNA的方法。本研究使用甜菜干种子或者叶片经真空冷冻干燥机处理1-2天后的干粉为原料，使用96孔PCR板代替单个离心管，利用碱裂解法对两种样品进行DNA的提取，该方法无需使用液氮，提取上百份DNA仅需要20分钟,提取的DNA能够作为SSR-PCR的模板。2．筛选出29对可用于指纹图谱构建的SSR核心引物。利用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对101对甜菜SSR扩增产物进行检测，共找到29对带型清晰、重复性好、多态性高、易于识别的引物，每对引物平均扩增出2～11个等位基因。扩增的片段大小在90～500bp之间，这29对引物可以作为甜菜品种纯度和真实性鉴定的核心引物。3．建立了甜菜多重SSR-PCR扩增体系。在单一SSR～PCR的基础上，甜菜2～3重SSR-PCR的体系为：每增加1重SSR，仅仅增加相应引物的量以及减少相应去离子水的量，其余成分不变。甜菜4～5重SSR-PCR要在单一PCR的基础上增加0.5倍的DNTPs以及相应引物的量，同时根据个别引物扩增效率的不同，相应减少个别引物的用量，此体系对大多数4重和5重PCR有效。多重PCR扩增体系的检测效率是单引物PCR的2～5倍。4.有7对引物可单独进行品种鉴定，利用其中3对引物构建了46个甜菜品种的SSR指纹图谱。聚类分析结果表明，在遗传距离0.20处，所有的品种被分为一类，在遗传距离0.16处，46个品种被分为4个类群，聚类分析结果与材料的来源有很好的一致性，基本上是同一公司或者同一国别的品种聚在了一起，从分子水平上说明了甜菜品种之间的遗传基础狭窄。另外，有7对引物SB04、S7、S6、BVV45、SB13、S13和S8单独使用时能够鉴别不同的品种，利用其中的3对引物SB04、S6和S7构建的指纹图谱就能区别所有的品种。5.建立了一套快速鉴定甜菜品种纯度和真实性的方法。该方法使用96孔PCR板，利用碱裂解法提取干粉DNA；使用GV及λ DNA检测提取样品DNA的浓度和质量； PCR反应体系为10μL；PCR反应程序将循环中的变性和退火温度均改为15s,延伸为30s，35个循环；PCR产物的分离使用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳；最后使用快速银染法对电泳后的聚丙烯酰胺凝胶进行检测；同时我们将模板DNA、引物稀释到工作浓度后和DNTPs以及PCR Buffer一起放入到冰箱保鲜层中，使用时不需要融化，可直接吸取，3个月内均能正常使用。利用以上的方法最终确立了一套简单、快速、节约、污染小的甜菜品种真实性和纯度的鉴定体系,促进了该技术的大规模使用，利用优化后的程序，一个成熟的实验室操作人员只需一天就可以完成192份样品的检测。