中国汉族人群系统性硬化症的候选基因关联分析研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:a81569476
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目的:系统性硬化症(Systemic sclerosis,SSc)是一种以纤维化为特征的自身免疫性疾病,遗传易感性在其发病机制中发挥重要作用。全基因组关联分析研究(genome-wide association study,GWAS)发现IRF5和IRF8基因均与白种人群中SSc患者相关。候选基因单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNP)研究结果也显示TNFSF4,TNFAIP3,CCR6,IRF5,IRF8和ALK1基因的SNP位点和不同种族人群的多种自身免疫性疾病具有相关性,但其是否与中国汉族人群中的SSc患者相关目前尚未有研究报道。因此,本研究的目的是探讨TNFSF4,TNFAIP3,CCR,IRF5,IRF8和ALKI基因与中国汉族人群SSc及其不同的临床亚组之间的相关性,如SSc伴随抗拓扑异构酶I抗体(Anti-topoisomerase I,也称为抗Scl-70抗体)阳性组,SSc伴随肺间质病变(Interstitial lung disease,ILD)组和SSc伴随肺动脉高压(Pulmonary hYPertension,PAH)组。方法:本研究纳入了1030例SSc患者和1215例健康对照,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF MS)方法对如下6个基因所选14个SNP位点进行基因分型:TNFSF4(rsl234314,rs2205960,rs12039904和rs844648),TNFAIP3(rs5029939,rs6932056和rs5029937),CCR6(rs3093023,rs10946216和rs3093005),IRF5 (rs4728142),IRF8(rs11642873和rSl1117432)和ALKl(rs2277382).结果:TNFSF4基因的位点rs844648等位基因和基因型频率都与SSc相关(p=1.7×10-3和p=5.0×10-3).TNFAIP3基因的位点rs6932056等位基因频率在疾病组和对照组之间有显著差异(p=5.0×10-3).TNFSF4其他三个位点(rsl234314,rs2205960和rs12039904)和TNFAIP3基因的rs5029939则与SSc表现出相对较弱的相关性(p<0.05)。上述六个SNP位点均与SSc-ILD亚组具有相关性。TNFSF4基因的单体型rs1234314-rs2205960CG和GT以及rs12039904.rs844648CG和TA均与SSc具有相关性。CCR6基因的位点rs3093023等位基因频率和基因型频率均与SSc显著相关(p=3.2×10-3和p=7.6×10-3).CCR6基因的单体型rs3093023-rs1094621 6AT和GC与SSc同样具有相关性(p=8.6×10-3和p=0.03)。IRF5基因的SNP位点rs4728142在等位基因和基因型频率上与SSc显著相关(p=2.8×104和p=6.6×104),并且与抗SCL-70抗体阳性亚组和SSc-ILD亚组具有相关性(p=2.77×104和p=6.64×104)。ALK1基因的位点rs2277382仅与SSc-PAH亚组显著相关(p=7.2×10-3)。结论:本研究在中国汉族人群中开展,结果证实了TNFSF4,TNFAIP3,CCR6和IRF5基因与SSc具有相关性,CCR6基因可能与不伴随ILD和PAH的SSc亚组相关,IRF8基因可能与中国汉族人群不伴随PAH的SSc患者之间具有相关性,ALK1基因与SSc-PAH显著相关,CCR6, IRF8和ALK1基因可能是SSc或其临床亚组的易感基因。
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