DNA错配修复基因多态与乳头状甲状腺癌的分子流行病学研究

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为广泛探讨乳头状甲状腺癌(PTC)的环境和遗传因素及其交互作用,我们在上海进行了以医院为基础的配对病例对照研究。共收集205例PTC患者和205例非肿瘤、非甲状腺疾病的住院病人作为研究对象。采用PCI-RFLP、PCR-PIRA-RFLP和PCR-ASO技术,应用关联分析、Logistic回归分析、单倍型分析、叉生分析和病例病例研究等方法,对参与DNA损伤修复的错配修复基因(hMLH1、hMSH2、hMSH3和hMSH6)的SNP和PTC发病的关联以及遗传和环境因素在PTC发生过程中的交互作用进行了探讨。结果如下: 1.hMLH1基因-93G>A和655A>G多态的等位基因和基因型频率在病例组和对照组的差异均无统计学意义(P>0.05)。1151T>A多态的等位基因频率在病例组和对照组的差异有统计学意义,以1151T等位基因为参照,1151A等位基因可以使PTC的发病风险升高,其OR值为2.07(95%Ch,1.04-4.33,P=0.026);1151T>A多态的基因型频率在病例组与对照组的差异无统计学意义,而以1151TT基因型为参照,具有TA或TA+AA基因型者,其PTC发病风险均升高,OR值分别为2.15(95%Ch 0.99-4.85,P=0.035)和2.15(95%CI:1.02-4.69,P=0.029)。按性别进行分层分析的结果表明,无论在男性还是女性中,-93G>A和655A>G多态均与PTC无关联(P>0.05);1151T>A多态与女性PTC存在关联,以1151TT基因型为参照,具有TT+TA基因型的女性,其PTC发病风险升高,OR为2.58(95%CI:1.06-7.01,P=0.027)。 2.hMSH2基因-118T>C多态的等位基因和基因型频率在病例组和对照组的差异均无统计学意义(P>0.05)。gIVS12-6T>C多态的等位基因和基因型频率在病例组与对照组的差异均有统计学意义,以gIVS12-6T等位基因为参照,gIVS12-6C可以降低PTC的发病风险,其OR为0.69(95%Ch 0.51-0.94,P=0.015);以gIVS12-61T基因型为参照,具有gIVS12-6CC或TC+CC基因型者,其PTC发病风险降低,OR分别为0.45(95%Ch 0.19-0.98,P=0.037)和0.63(95%CI:0.42-0.96,P=0.023)。按性别进行分层分析的结果表明,无论在男性还是女性中,-118T>C多态均与PTC无关联(P>0.05);而gIVS12-6T>C多态与女性PTC存在关联,以gIVS12-6TT基因型为参照,具有TC或CC基因型的女性,其PTC发病风险均降低,OR分别为0.62(95%CI: 0.38-1.03,P=0.049)和0.26(95%CI:0.09-0.74.P=0.005)。 3.hMSH3基因3124A>G和2835G>A多态、hMSH6基因rs3136245T>C多态的等位基因和基因型频率在病例组和对照组的差异均无统计学意义(P>0.05)。按性别进行分层分析的结果表明,无论在男性还是女性中,hMSH3基因3124A>G和2835G>A、hMSH6基因rs3136245T>C多态均与PTC无关联(P>0.05)。 4.在对错配修复基因多态、年龄、性别、饮食因素和其它环境因素拟合的多因素条件Logistic回归模型中,hMLH1基因115lTA+AA基因型、hMSH3基因3124GG基因型、hMSH3基因2835GA基因型、hMSH6基因rs3136245TC基因型、既往CT检查史、肿瘤家族史、负性生活事件和喜食海鲜是PTC的危险因素,OR分别为5.47、9.14、166.70、4.33、105.84、8.52、39.03和49.17:而hMSH2基因gIVS12-6CC基因型、X线照射史、20年前经济水平高、经常饮茶和喜食水果是PTC的保护因素,OR分别为0.15、0.23、0.14、0.37和0.10。进一步将女性生育相关因素放入模型中,仅对女性研究对象进行分析,结果显示,hMLH1基因1151TA+AA基因型、hMSH3基因2835GA基因型、妇科疾病史、既往CT检查史和经常吃花生是女性PTC的危险因素,OR分别为8.70、156.70、105.22、49.72和9.13。MMSH2基因gIVS12-6CC基因型、月经规律年龄≤15岁、20年前经济水平高、经常吃豆制品、经常饮茶和经常吃水果是女性PTC的保护因素,OR分别为0.14、0.01、0.15、0.12、0.09、0.14和0.11。 5.应用乘积极限法进行分析的结果显示,hMLH1、hMSH2、hMSH3和hMSH6基因的各基因型与PTC的发病年龄均无关。 6.连锁不平衡检验的结果显示,hMLH1基因1151T>A和655A>G多态位点之间呈连锁平衡,而hMLH1基因-93G>A和1151T>A多态、-93G>A和655A>G多态以及hMSH2和hMSH3基因多态位点间均存在不同强度的连锁不平衡,D’值在0.53-0.83之间。对hMLH1、hMSH2和hMSH3基因各SNP组成的单倍型分析的结果表明,各单倍型在病例组与对照组的分布均无统计学差异。各单倍型与PTC的关联分析显示,以hMLH1基因G<-93>T<-1151>A<655>单倍型为参照,具有G<93>A<1151>A<655>单倍型者,其PTC发病风险升高1.67倍(OR=2.67,95%CI:1.16-6.53,P=0.011):以hMSH2基因TT<118>单倍型为参照,具有CC<-118>单倍型者,其PTC发病风险降低,OR为0.60(95%CI:0.36-0.99,P=0.036);以hMSH3基因A<3124>G<2835>单倍型为参照,具有G<3124>A<2835>单倍型者,其PTC发病风险升高2.08倍(OR=3.08,95%CI:0.92-13.25,P=0.043)。 7.在评价基因一环境交互作用中,Logistic回归分析显示,hMLH1基因1151T>A多态与环境因素不存在交互作用。hMSH2基因gIVS12-6TC+CC与喜食水果存在负相乘交互作用(OR<,inter>=0.39,95%CI:0.17-0.90),表明经常吃水果能降低具有gIVS12-6TC+CC基因型者罹患PTC的风险。该多态与其它环境因素不存在交互作用。 8.叉生分析显示,hMSH6基因rs3136245TC+CC与经常接受CT检查存在相加和相乘正交互作用,OR<,inter>值分别为0.17和1.01,经常接受CT检查会增加rs3136245TC+CC基因型者罹患PTC的风险。该多态与其它环境因素不存在交互作用。 9.病例病例研究未发现hMSH3基因3124A>G多态与环境因素存在相乘交互作用。女性hMLH1基因115IT>A多态与口服避孕药及hMSH2基因gUVS12-6T>C多态与口服避孕药之间均不存在交互作用。
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