2015年以来,新三板建设作为完善资本市场建设重要环节发展迅速。截止2016年3月,新三板市场挂牌交易企业总数已超过6000家,总交易股本数超3600亿股,成为我国资本市场发展最迅速的板块。在新三板快速发展的同时,也暴露出包括企业估值等方面的问题。本文从新三板市场特征、挂牌企业发展情况着手,分析该市场挂牌企业在交易估值方面暴露的问题,同时对几种常用的企业估值方法进行了利弊分析和适用性分析,最终选择实物期权法作为新三板企业估值方法,并作了实证检验。实物期权定价法的估值思路与传统企业估值方法不同(后者更注重分析企业财务数据以及以往发展情况)主要考虑企业未来发展前景,因而更适合于新三板市场企业估值。由于新三板交易相对不活跃、数据收集存在困难,本文实证分析部分仅选取新三板市场中交易相对活跃的软件服务行业与主板对应行业进行价格比较,但研究发现该板块新三板交易价格相对主板普遍偏低的结论仍具有一定代表性。运用实物期权Black-Scholes期权定价模型进行实证分析后的企业价值得到修正,更接近于主板市场价格,由此证明实物期权法是一种比较适合于新三板企业估值的方法,在新三板企业股权交易定价的博弈中可以作为交易各方的议价工具。