改革开放以来,民办高等教育复苏并发展壮大,已成为我国高等教育重要组成部分,但民办高校办学经费的短缺是其健康发展的一大瓶颈。虽然我国法律法规对民办高校进行了资助与扶持的努力,但与公办高校相比,还没有明晰实施办法,不具有强制性。为了使民办高校健康发展,要创新民办教育发展体制机制,改善民办教育发展环境。本文主要运用政策科学的一些基本原理及其相关的概念,对我国公共财政资助民办高校的政策进行研究,提出政策建议。第一部分为绪论,介绍相关概念,研究的主要内容与研究方法；第二部分,介绍了公共财政资助民办高校的必要性与重要性；第三部分通过对国家已有的关于资助民办高校和公办高校的法律法规进行梳理、分析,厘清中央主管部门、地方政府对民办高等教育扶持的政策变迁及具体方式,并进行对比分析；第四部分通过对比较分析,阐述目前在政策制定及执行中存在的问题及原因,总结中央及地方政府各部门在制定政策的经验；第五部分提出政策建议,分析公共财政资助民办高校的主体、条件及其对象,从财政与政策资助两方面着手,财政方面政府提供直接的经费资助；政策方面,首先改变对民办高等教育的认识,从减免税费、改变民办教师的待遇与财政贴息等方面着手,构建中央政府与地方政策对民办高等教育的扶持政策的体系。