从国际上看,上海与香港、新加坡、鹿特丹等世界级国际航运中心的主要差别之一,就是缺少一个高效的自由港或自由贸易区政策。在上海实行自由贸易区政策,将加强其国际物流、贸易、加工、金融服务等功能,也会提高上海对国际货物中转的吸引力,扩大中转贸易,进而提高上海港的国际地位,对上海航运业发展具有重大的推动作用。经过近40年的发展,自由贸易区已遍及全球的100多个国家和地区。尤其是在发展中国家,更是重视自贸区的建设。上海自贸区将提高为航运业发展提供更大的开放度和优惠政策,将简化办理手续、降低航运成本、实现境内关外的政策,因此而带来吸引外资、扩大就业、促进区域经济发展、增加国际贸易额等好处。本文在总结国内外对自贸区研究成果的基础上,结合上海航运业发展现状,以及上海自贸区政策的实际情况,分析了上海自贸区的设立对上海航运业发展的影响因素。鉴于航运业覆盖范围和相关产业十分复杂,并且自贸区的影响具有太多的不确定因素,本文建立的影响指标体系只选取了具有代表性的7个一级指标和20个二级指标。通过发放调查问卷的方式收集相关数据,采用层次分析法计算得到权重,得出上海自贸区的设立受到最大影响是航运基础贸易,其次是航运信息环境,然后依次是航运金融市场、航运市场基本指标、港口基础设施、人力资源环境、政府支持类。然后给予指标体系运用模糊综合评价法,分析对比了上海、香港、新加坡航运业的发展现状。最后,根据评价结果,有针对性的提出了提升上海航运业的措施。