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木霉(Trichoderma)是真菌中重要的生物防治菌之一。本文以从土壤中分离获得的具有抑菌作用的钩状木霉(Trichoderma hamatum)为研究对象,采用比较基因组学和蛋白组学等方法,分析差异基因和差异表达蛋白,探索该钩状木霉菌产生抑菌作用的机理,并通过实时荧光定量PCR对差异基因表达进行验证。主要的研究结果如下：1.从致病菌区土壤中分离与鉴定出对烟草青枯病有生物防治效果的钩状木霉菌株YYH13和无生物防治效果的YYH16。YYH13代谢产物和发酵液对青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)有明显的抑制作用,发酵液在80℃以内能保持抑菌活性,120h的发酵液抑菌效果最好。田间试验进一步验证了YYH13菌剂对烟草青枯病有较好的防治作用。2.采用硫酸铵沉淀法从发酵液中分离得到具有抑菌活性的蛋白质组分,SDS-PAGE法分析YYH16和YYH13发酵液的差异蛋白,确定差异蛋白的分子量范围为80-100 kDa、40-50 kDa和20-30 kDa。用LC-MS/MS初步鉴定出125个差异蛋白质。以Mascot库为基准,从8个蛋白质片段中筛选到与生物防治密切相关的内切几丁质酶同源蛋白质特征片段IVLGMPIYGR。3.完成YYH13和YYH16的全基因组测序、拼接和组装,YYH13基因组为43.29M, YYH16为49.83M。分别预测了11316个和11087个具有编码功能的基因,注释分析了6648个和6110个GO分类。与Trichoderma atroviride、 Trichoderma harzianum、Trichoderma reesei、Trichoderma viren进行木霉属种间之间的基因家族收缩与扩张以及酶类的比较分析,筛选到78个与生物防治相关基因家族,重点对其中13个基因家族开展系统的进化分析。分析了两个基因组之间的异同点,预测了蛋白的功能及其所参与的代谢过程和特有基因作用网络,其中有3个是YYH13生物防治烟草青枯病的关键基因家族。4.结合比较基因组学和蛋白质组学的分析结果,采用qRT-PCR分析不同诱导时间对YH13107(内切几丁质酶基因)和YYH1311002(MAPK家族基因)的转录差异以及不同碳源对YYH132757(外切β-1,3-葡聚糖酶基因)和YYH1311002 (MAPK家族基因)的转录差异,克隆了钩状木霉内切几丁质酶基因chitl8-18,并对该基因的序列和结构进行了分析和预测。