随着新能源的不断使用，以清洁型能源沼气为主要产品沼气项目在我国各地不断被推广，政府对沼气项目的补贴也不断加大，但是，与此同时，在现有的对沼气项目的效益分析方面却存在很大的问题，例如：在进行效益分析时，没有区分财务效益和经济效益：许多效益分析没有数据支持。本文就从现有对沼气项目效益分析出现的问题出发，以世界银行贷款中国的农村生态家园项目中沼气部分为例，分别从沼气项目的财务效益和经济效益分析入手，对沼气项目效益计量方法进行详细的探讨，最终得出一套现阶段适合农户沼气项目的科学的可操作的效益分析方法。并且，本文还使用案例项目的数据，对案例项目中模式农户的内部收益率和净现值这两个效益分析指标进行计算，根据计算结果，分析了农户沼气项目效益分析结果和政府补贴的关系，为现阶段我国政府对沼气项目的补贴政策，包括是否补贴、补贴力度提供实际依据。 以农户沼气项目为借鉴，本文还可为类似于沼气项目的，政府支助类农村项目的效益分析方法和政府对这类项目的补贴政策的制定提供参考。