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选取来自不同生态区域的苎麻野生种质30份，地方栽培品种8份，运用同工酶技术和RAPD、ISSR分子标记技术进行苎麻野生种质资源遗传多样性和亲缘关系分析，得到如下结果：1．同工酶分析结果显示：38份材料共检测到146条酯酶同工酶谱带，统计表明每个栽培种产生酶带数7～9条不等，野生种产生酶带数1～5条不等。共有21条酶带类型，迁移率在Rf0.381～0.835之间。聚类分析结果显示材料间相似系数在0.429～1.00之间。在相似系数0.79水平处，可以将材料分为5大类群。2．RAPD-PCR反应体系的优化，从差别较大的苎麻属栽培种和序叶苎麻种中各选一个材料的DNA为模板，对RAPD扩增体系进行双重正交优化，优化后的RAPD-PCR反应体系适合于众多苎麻属植物。25ul反应体系中，引物浓度为0.75umol／L；模板DNA的用量为150ng；Mg2+浓度为2.1mM；dNTP浓度为0.2mM；Taq酶用量为1.5U。扩增程序为：先94℃变性4min，再94℃变性45sec、37℃复性45sec、72℃延伸90 sec共36个循环，最后72℃延伸10 min，4℃保存。3．利用RAPD和ISSR两种标记对38份材料进行了遗传多样性分析。统计表明：31条RAPD引物，扩增出358条带，平均产出率11.5条带／条引物；而18对ISSR引物共扩增出266条带，平均产率14.8条带／条引物。对该结果分别用NTSYS软件进行聚类分析结果表明：在0.73的相似水平上，均可将38份材料分成8大类群，RAPD聚类分析体现材料分类结果有地域性。4．将分子标记RAPD、ISSR所得到的数据，用NTSYS软件进行混合分析，其聚类结果图分别与RAPD和ISSR聚类图比较，混合数据的聚类图与ISSR分析聚类图的结果比较接近。两种标记（RAPD和ISSR）的分析结果呈极显著相关（r=0.92027）。表明RAPD与ISSR均适合苎麻野生种质资源遗传多样性分析，ISSR技术在苎麻野生种质遗传多样性分析上比RAPD更适用。