高通量药物筛选病毒芯片的研制

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G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors, GPCR)作为最大的人膜蛋白受体家族,在细胞存活、维持细胞平衡、免疫监测、分子转运及神经调节等方面具有重要作用。因此目前全球市场70%以上的治疗药物都是针对GPCR,因此日益成为生物医药研究的重点、热点和难点。但是GPCR高度疏水的7次跨膜结构,灵活的构象仍然给体外研究其功能活性造成了巨大的困难,因此构建一种筛选GPCR功能活性的平台无疑对药物高通量筛选具有重要意义。目前新药筛选方法主要是在药物与某一种细胞GPCR相互作用后,借助荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer, FRET)等生物物理方法,检测细胞内分子间相互作用激发的化学荧光信号,从而发现具有特定疗效的药物。虽然这种在细胞水平的方法稳定、适于自动化,但是仍然存在无效信号或信号偏差导致筛选过程复杂化,成本高、集成度小、筛选效率低。因为病毒包膜上有许多规则排列的糖蛋白,如HSV-1的主要包膜糖蛋白gB(glycoprotein B, gB)、gC (glycoprotein C, gC),所以本研究中提出采用HSV-1病毒为载体,将具有代表性的人膜蛋白CD4(单次跨膜蛋白的模式蛋白)、GPCR77(多次跨膜蛋白的模式蛋白)像gB、gC那样整合在球形的HSV-1包膜上,然后把病毒加载到芯片上。这种芯片将锚定各种GPCR,有望在一次芯片反应中筛选出具有活性的GPCR,为药物的高通量筛选搭建新的平台。本论文研究主要内容及结果如下:[1]制备gB:CD4、gB:GPCR77、gC:CD4、gC:GPCR77四种HSV-1重组病毒因为HSV-1是双链DNA,本文通过两种基因重组方法对HSV-1基因组编辑,表达外源天然膜蛋白或融合蛋白,通过病毒在细胞内的组装,制备gB:CD4、gB:GPCR77、gC:CD4、gC:GPCR77四种HSV-1重组病毒。gB:CD4、gB:GPCR77上的人膜蛋白CD4、GPCR77由HSV-1gB基因启动子表达,gC:CD4、gC:GPCR77上的CD4、GPCR77是CD4-gC和GPCR-gC的融合基因,由HSV-1gC基因启动子表达。该融合基因由CD4基因(去掉CD4跨膜区)、GPCR77基因(去掉最后一个跨膜区)分别与gC基因跨膜区和C-末端序列(32个氨基酸基因序列)融合而成。i.采用HSV-1病毒系统。在A.1.1细胞内,将克隆在PK△4B△gBss质粒上的CD4基因、GPCR77基因(包括基因全长编码序列、末端加进的14个氨基酸V5epitope tag序列及终止密码子TAG)分别重组到序列部分缺失的HSV-1基因组中gB基因的启动子下,制备人膜蛋白HSV-1重组病毒gB: CD4、gB:GPCR77。试验结果:a.通过免疫荧光试验(immunofluorescence assay, IFA),应用CD4、GPCR77荧光抗体对gB:CD4、gB: GPCR77感染的细胞表面染色,发现具有很好的荧光信号。gD荧光抗体在所有感染细胞表面都有荧光信号(阳性对照),但是野生型HSV-1(KOS)感染的细胞表面(负对照①)和没有病毒感染的细胞表面(负对照②)都没有检测到荧光信号。V5荧光抗体对感染细胞内染色,发现都呈现了强的荧光信号,说明CD4、GPCR77在细胞内获得了正确表达,并且在内质网、高尔基体、细胞表面有翻译后修饰的动态处理过程。b.通过细胞免疫印迹试验(western blot, WB)和35S-methionine放射性活性标记的免疫沉淀试验(immunoprecipitation, IP)分析,在胶图gD条带大小相近,确保各种感染病毒数量一致的条件下,gB:CD4、gB:GPCR77感染的HFT细胞出现了清晰的CD4、GPCR77条带,而KOS病毒(HSV-1野生型,负对照①)和K082病毒(HSV-1gB基因缺失,负对照②)感染的HFT细胞则没有相应分子量条带的出现,与IFA试验结果相吻合。c.通过流式细胞仪(flow cytometry, FCM),PE-conjugated的荧光抗体在HSV-1病毒表面成功检测到了CD4、GPCR77的荧光信号。结论:CD4、GPCR77分别整合到了gB:CD4、gB:GPCR77包膜,且在膜上整合的方向是正确的。ii.采用RED/ET Ecoli的细菌重组系统。通过两步将CD4-gC、GPCR77-gC融合基因同源重组进HSV-1基因组中,制备gC:CD4、gC:GPCR77重组病毒。结论:WB、IP、FCM生化试验证明,这种通过基因融合的方法把融合蛋白CD4-gC、 GPCR77-gC也整合到了HSV-1包膜,并且荧光信号比gB: CD4、 gB:GPCR77更强。[2]构建病毒芯片取4种不同芯片表面,设计不同病毒浓度梯度(2倍稀释)和对照组,然后将野生型HSV-1加载在芯片上,发现FAST玻片具有最好的检测水平。由于gD荧光抗体信号强弱对病毒浓度梯度具有依赖性,可以确定最佳的芯片病毒加载量为800,000个/spot。试验结果:通过Cy5标记的anti-CD4、anti-GPCR77抗体检测芯片上的信号检测,发现gB:CD4、gB:GPCR77、gC:CD4、gC: GPCR77四种重组病毒荧光信号显著,但是KOS(HSV-1野生型,负对照①)和K082(HSV-1gB基因缺失型,负对照②)则没有信号,再一次证明CD4、GPCR77整合到了相应的重组病毒上,但在芯片上发现Cy5-标记的C5a配体仅能够特异的识别gC:GPCR77,却很难识别gB: GPCR77。结论:CD4、GPCR77分别整合到了HSV-1包膜,但是GPCR77只在gC: GPCR77上保持完好的构象和活性,这为构建完整的GPCRs药物筛选芯片奠定了坚实的基础。病毒芯片的成功构建将对生物医药领域产生重大影响,将为活性药物筛选、分子配体的鉴定、以及膜蛋白结构功能研究建立一个很好的平台。
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