在聚丙烯酰胺凝胶上分别建立一种DNA、糖基化蛋白质检测方法的研究

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目的:   1.在聚丙烯酰胺凝胶上建立一种检测DNA的方法;   2.在聚丙烯酰胺凝胶上建立一种特异性检测糖基化蛋白质的方法。   方法:   1.DNA染料染色检测法:选用碱性品红作为染料,首先初步建立一种检测方法,之后考察各个对染色结果产生影响的因素,如染色液组成、染色时间以及脱色时间等,确定各个条件,逐步完善初步建立的检测方法,最终建立完整的DNA染料染色检测方法。   2.糖基化蛋白质荧光检测法:选用丹酰肼作为染料,首先初步建立一种检测方法,之后考察各个对染色结果产生影响的因素,如固定液组成、染色液组成、脱色液组成以及各个步骤的时间等,确定各个条件,逐步完善初步建立的检测方法,最终建立完整的糖基化蛋白质检测方法。   结果:   1.建立了一种完整的DNA染料染色检测方法,可在凝胶上检测出10-20 pg/band的DNA,其灵敏度比商业化荧光染色试剂盒SYBR Gold高4倍,与GEHealthcare公司的DNA银染试剂盒灵敏度相近,且机理实验表明碱性品红和DNA的结合方式为非嵌入式结合,与经典EB荧光检测法的嵌入式不同,无致畸毒性。本方法操纵步骤如下:   (1)固定:将电泳后的凝胶置于50 ml固定液中固定30 min,固定液组成:40%乙醇/10%乙酸;   (2)染色:将凝胶置于50 ml染色液中染色5 min,染色液的组成:0.04%碱性品红水溶液;   (3)水洗:将凝胶置于50 ml去离子水中洗涤2次,每次10s;   (4)显影:将凝胶置于50 ml0.1%铁氰化钾(35-50℃)显影2min;   (5)终止:将凝胶置于去离子水中(35-50℃)终止显影。   2.建立了一种完整的糖基化蛋白质荧光染色检测法,可在凝胶上检测出2-8ng/band的糖基化蛋白质,其灵敏度与商业化糖基化蛋白质染色试剂盒Pro-Q Emerald相近。本方法操作步骤如下:   (1)固定氧化:将电泳后的凝胶放入固定氧化液固定氧化10m in,固定氧化液组成:40%乙醇/10%乙酸/0.5%高碘酸;   (2)酸洗:将凝胶置于3%乙酸洗涤3次,每次5 min;   (3)染色:将凝胶置于染色液中染色40 min,染色液组成:0.6%丹酰肼/0.5%氯化镁/3%乙酸;   (4)脱色:将凝胶置于脱色液一和二中各脱色10 min,脱色液一组成:0.1%乙酸锌/3%乙酸,脱色液二组成:3%乙酸。   结论:   1.本实验在聚丙烯酰胺凝胶上建立了一种DNA染料染色检测法,该方法灵敏度高,且机理实验结果表明碱性品红与DNA的结合方式为非嵌入式结合,安全无致畸性,有望代替经典EB荧光染色法;   2.本实验在聚丙烯酰胺凝胶上建立了一种糖基化蛋白质荧光检测法,该方法具有灵敏度高、特异性强、操作便捷等优点,适合糖基化蛋白质组学研究。
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