南水北调中线工程是我国为解决北方水资源短缺、实现水资源优化配置而实施的重大战略工程。丹江口水库是南水北调中线工程的水源地，其水质的好坏直接关系到工程的效益与成败。保护好丹江口水库的水质，确保一库清水向北流，已经成为社会关注的热点。保护好核心水源区水环境安全，服务好南水北调是中央和地方的共同责任，只有上下齐心，共同努力，才能确保“一库清水向北流”。通过跨界水质保护的府际合作，在省际之间、市与市之间、县与县之间合作的基础之上进行跨区域、综合化、社会化来引发全流域、全社会共同解决、治理是确保和优化水质的关键所在。　　 论文的结构：　　 绪论部分，阐述本文研究目的、问题提出的原因与研究意义；核心概念的界定；已有研究述评；研究方法与主要内容；研究的创新之处。　　 第二章分析了建立丹江口水库水质保护协作机制的必要性和可行性。通过对水源区地方情况的深入研究，明晰了行政体制的分割、环境制度的缺失、协调和合作组织的缺位等是府际合作的困境。　　 第三章探讨了国际国内跨流域水污染治理中府际合作成功经验。　　 第四章从制度和技术两个层面提出了完善水源地水质保护府际合作的建议。　　 本文试图运用整体政府理论，对南水北调中线水源区水质保护的府际合作进行了分析和探讨。通过对发达国家流域政府间合作的比较研究，进行实证分析，发掘地方政府合作跨界水污染治理的特色并给以制度与文化视界的诠释，更阐明共同趋势所在。提出了设立统一的环境监管机构，健全法律体系，建立完善的流域水管理体制是创立跨界水污染协调合作机制的基石，丰富了水源地水质保护府际合作之路的探索和思考。