本试验选用10对微卫星引物及20个随机引物，分析了岭南黄鸡K、F、A三个品系的遗传差异、群体内杂合度、群体内条带共享率、遗传多样性指数，并用两种分子标记计算的遗传距离对K×F、K×A杂交后代的初生重及2、4、6、8周龄体重的杂种优势和杂种优势率进行相关分析，探测出与杂种优势(率)有显著相关关系的等位基因。 试验结果表明，两种分子标记都表现出丰富的多态性。所用10个微卫星标记检测到了鸡基因组9个位点的遗传变异，平均每对引物可检测4.2个等位基因，平均多态信息含量为0.44；20个随机引物中有13个能产生可重复的试验结果，这13个随机引物共检测了鸡基因组117个位点的遗传变异，平均每个引物产生可重复的主带9条，每个引物产生的多态性条带平均为5.4条。 由微卫星多态性试验得出的杂交亲本个体间的遗传距离与RAPD试验得到的遗传距离有一定差异，两者的相关性弱。由微卫星标记计算出的群体平均杂合度和由RAPD计算出的群体遗传多样性指数这两个参数从两个方面反映了群体的遗传纯度，但由前者反映出的岭南黄鸡K、F、A三个品系的遗传纯度大小顺序为K＞A＞F，后者则为F＞A＞K。究竟用哪种标记得出的群体遗传纯度符合实际情况，有待于进一步研究。两种标记得出的亲本个体间的遗传距离与后代杂种优势率的相关分析结果表明，大多数只有弱的正相关或负相关，但KXF亲本个体间微卫星遗传距离与第8周龄体重杂种优势和杂种优势率有显著中等程度相关关系，K×F亲本个体间RAPD遗传距离与初生重杂种优势和杂种优势率有显著中等程度相关关系。 MCW0073的等位基因267bp、MCW0148的等位基因124bp对初生重的杂种优势和杂种优势率有显著正相关，而MCW0073的等位基因250bp、230bp和215bp及MCW0148的等位基因111bp和89bp对初生重的杂种优势和杂种优势率有显著负相关。另外，MCW0148的等位基因118bp与初生重杂种优势和杂种优势率可能有显著的正相关。检测到随机引物R03在F系中有特异性的扩增条带(500bp、550bp)，R12在A系有特异性扩增条带(280bp、340bp)，其余所有引物在3个群体中均无群体特异性条带。但所有引物检测到各个位点的条带频率在群体间有明显差异。 为了使试验结果更准确，应尽量研究更多位点的变异以获得基因组遗传变异更全面的信息。利用分子标记进行杂种优势预测的首要工作是寻找与决定某一性状的QTL相连锁的各种多态性好、重复性好的分子标记，随机选择的分子标记很难用于杂种优 势的准确预测。由于杂合性（遗传距离）与杂种优势的相关性存在极大差异，对于应用 DNA多态性标记探测亲本间基因杂合性（异质性）来预测杂种优势还难以作出明确的 回答。因此，利用分子标记做杂种优势预测还有待于对杂种优势遗传基础的进一步认 识。