基于线粒体COI基因的蝇蛹金小蜂种群遗传多样性分析及Wolbachia感染与其线粒体基因多样性的关联

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蝇蛹金小蜂Nasonia vitripennis,作为具有世界性分布的重要的遗传模式生物,是研究生物系统发育和进化的良好材料。关于其在北美洲和欧洲的不同地理种群的系统发育情况前人已进行调查,本研究结合已有调查结果,通过对中国蝇蛹金小蜂六个地理种群的线粒体COI基因进行序列分析,对我国蝇蛹金小蜂种群间的遗传多样性及遗传分化情况进行了初步研究,并与北美洲和欧洲种群进行比较。同时对所采集的不同地理种群的蝇蛹金小蜂Wolbachia感染情况进行了检测,分析了Wolbachia感染与其线粒体COI基因多样性的关联。研究结果如下:1.基于线粒体COI基因的不同地理种群的蝇蛹金小蜂的遗传多样性分析:(1)为分析我国蝇蛹金小蜂不同地理种群的遗传变异情况,对六个地理种群48头蝇蛹金小蜂的线粒体COI基因片段进行了测序分析。在获得的619bp大小的线粒体COI基因片段中共发现63个单倍型和97个变异位点,其中包括30个简约信息位点和67个自裔位点。A+T含量为72.3%,G+C含量为27.7%,表现出明显的A/T碱基偏向性。(2)基于线粒体COI基因的NJ系统发育树显示,整体上中国、欧洲和北美洲三个种群的蝇蛹金小蜂各自聚在一起,聚类结果与自然地理种群分布有明显的规律性和一致性,Mantel检验同样表明,各地理种群的遗传距离与地理距离间具有显著的相关性。(3)总体上中国种群单倍型多样性指数Hd为0.856,核苷酸多样性指数Pi为0.00919,多样性水平明显高于北美洲,低于欧洲;和其他种群相比,新疆种群明显的表现出较高的多样性水平,接近欧洲和北美洲的种群。(4)中国六个地理种群间的平均基因流Nm为0.65,总群体的固定系数Gst为0.277,表明中国蝇蛹金小蜂地理种群的基因流水平较低,种群间产生了一定程度的遗传分化,其中浙江种群和芜湖种群遗传分化程度较高。AMOVA分子方差分析结果表明,中国蝇蛹金小蜂地理种群的遗传分化主要来自种群内(68.360%)。(5)基于线粒体COI基因的不同地理种群蝇蛹金小蜂的中性检验结果显示,北美洲种群和欧洲种群的Tajima’s D值均不显著(P>0.05),但我国Tajima’s D值为显著的负值(P<0.05),说明我国蝇蛹金小蜂种群在过去可能出现过群体扩张和持续增长模式。2. Wolbachia感染与不同地理种群蝇蛹金小蜂线粒体COI基因多样性的关联:Wolbachia感染情况为新疆、芜湖和浙江种群全部感染,黑龙江、南岭、北京的感染率为62.5%、57.1%和71.4%。基于线粒体COI基因对黑龙江、南岭和北京三个种群的感染Wolbachia的个体和不感染Wolbachia的个体进行多样性分析,发现感染Wolbachia种群个体的多样性水平明显低于不感染Wolbachia种群的个体。
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