目的:应用插入缺失多态性(Insertion/Deletion Polymorphism,In Del)遗传标记,构建一套适合于中国主要人群、具有高个人识别能力、可在法医学DNA实验室推广使用的多重PCR复合扩增荧光检测系统,旨在为法医DNA检测分析提供有效的新工具。方法:1.采用UCSC、Genome Browser和NCBI db SNP筛选适用于中国主要人群、具有高个人识别能力,覆盖于人类22对常染色体及性别染色体上的In Del遗传标记。2.建立包含四色荧光标记(FAM、HEX、TAMRA和ROX)的多重PCR复合扩增荧光检测系统。分子量内标采用第五色荧光染料LIZ500橙色荧光标记,组成45个In Dels基因座的复合扩增体系(简称45-In Dels)。对构建的In Del复合扩增分型体系进行包括引物配比浓度、DNA模板量、退火温度等PCR反应条件的调整优化,得到均衡稳定的PCR产物分型结果,实现45个In Dels基因座的单管复合扩增检测。3.根据构建的45-In Dels基因座的电泳迁移率文件和3130XL遗传分析仪的Gene Mapper ID v3.2.1软件要求建立panel、bin分析文件,使用五色荧光Matrix文件与LIZ500分子量内标,建立了基于3130系列遗传分析仪的自动毛细管电泳检验方法。4.对已构建复合扩增体系进行种属特异性、灵敏度、稳定性、适用性等法医学验证,并调查遗传标记的法医学参数。结果:1.本论文研制了覆盖人类全基因组22条常染色体及性别染色体的45-In Dels基因座的多重PCR复合扩增荧光检测系统,并建立了适用于3130、3100、3500系列遗传分析仪的自动化分型方法。2.构建的45-In Dels复合扩增体系在DNA模板量低至500 pg时可以获得完整分型,具有种属特异性,重复性好,适用性强。3.对200人份无关个体进行45-In Dels基因座的复合扩增检测,获得了这些基因座的等位基因频率以及基础法医学参数,其中常染色体上27个In Del基因座平均杂合度达到0.56,平均个人识别概率达到0.60,多态性信息容量(除rs2307783位点外)均大于0.3,CPD和CPE分别达到0.9999和0.9859以上;对于X染色体上16个In Del基因座,在女性群体中的累积个体识别概率(CPDfemale)为0.999997,在男性群体中的累积个体识别概率(CDPmale)为0.999787,三联体和二联体的累积平均排除率(CMECTrio和CMECDuo)分别达到0.9978和0.9732以上。Y染色体上的两个基因座在检测样本中均能达到性别判断的要求,在男性样本中检测到单一峰,在女性样本中均未检见分型结果,两个位点在调查人群中的GD值分别为0.47和0.27。结论:45-In Dels复合扩增体系可提供27个常染色体、16个X染色体及2个Y染色体的多态性遗传标记信息,检测片段短,适用于法医学常见检材及降解检材,为法医学研究及实际工作提供了新的补充检测手段。