背景与目的:甲状腺癌（thyroid cancer,TC）是内分泌系统中最常见的恶性肿瘤,近年来其发病率在全球范围内呈快速上升趋势。其中,甲状腺乳头状癌（papillary thyroid carcinoma,PTC）是甲状腺肿瘤中最常见的组织学类型。多数甲状腺乳头状癌呈惰性生长,但仍有少数病人可出现腺外侵犯、淋巴结、肺、脑转移等。缺乏对侵袭性甲状腺乳头状癌的有效诊断手段是限制治疗效果或导致过度治疗的关键,也是亟待解决的重要科学问题。肿瘤异质性是恶性肿瘤的特征之一,与肿瘤侵袭性行为和耐药性有关。根据以往研究报道,甲状腺乳头状癌的突变负荷较少,而表观遗传学的改变相对较多,且表观遗传学改变可影响基因功能,造成生物学行为的改变。本研究旨从DNA甲基化角度探讨甲状腺乳头状癌的瘤内异质性,并探究瘤内甲基化异质性基因判断淋巴结转移的诊断价值。方法:从文献及实验室的前期工作结果中筛选出甲状腺乳头状癌中5个异常高甲基化的基因（AP2、CDH1、DACT2、HIN1、RASSF1A）。在135名甲状腺癌患者的同一肿瘤内采集了三块大小相近但空间位置不相邻的肿瘤标本。采用甲基化特异性PCR（methylation specific PCR,MSP）检测样本中上述5个基因的甲基化状态,比较三块组织甲基化检测的结果以确定基因是否具有DNA甲基化瘤内异质性。通过卡方分析探究5个基因甲基化瘤内异质性与临床因素之间的关系,初步探究影响基因甲基化瘤内异质性的因素及基因甲基化瘤内异质性与淋巴结转移之间的相关性。将与淋巴结转移相关的甲基化异质性基因与其他临床指标联合判断淋巴结转移情况,采用受试者工作特征曲线（receiver operating characteristic,ROC）并结合曲线下面积（area under the curve,AUC）检验诊断效能。结果:综合三块组织后的基因甲基化率与单块标本检测相比明显提高;5个基因的DNA甲基化瘤内异质性在甲状腺乳头状癌中广泛存在;AP2、CDH1、DACT2的甲基化异质性与肿瘤大小显著相关;CDH1的甲基化异质性与淋巴结转移呈负相关;通过对临床数据分析发现患者年龄与肿瘤大小是影响淋巴结转移的危险因素。将年龄、肿瘤大小及异质性甲基化CDH1联合后其诊断淋巴结转移的AUC最高,可达到0.751。结论:本研究揭示了甲状腺乳头状癌中存在广泛的DNA甲基化改变,而且存在甲基化瘤内异质性;瘤内甲基化异质性与临床病理特征之间存在显著相关性。CDH1存在甲基化异质性时,可以提示淋巴结转移风险降低。总之,瘤内DNA甲基化异质性可能是解释甲状腺癌生物学行为多样性的重要视角之一,值得进一步研究。